Protein–RNA interactions for Protein: Q96K49

TMEM87B, Transmembrane protein 87B, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM87BQ96K49 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TMEM87BQ96K49 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TMEM87BQ96K49 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TMEM87BQ96K49 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TMEM87BQ96K49 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TMEM87BQ96K49 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TMEM87BQ96K49 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TMEM87BQ96K49 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TMEM87BQ96K49 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TMEM87BQ96K49 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
TMEM87BQ96K49 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TMEM87BQ96K49 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
TMEM87BQ96K49 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TMEM87BQ96K49 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TMEM87BQ96K49 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TMEM87BQ96K49 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TMEM87BQ96K49 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TMEM87BQ96K49 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TMEM87BQ96K49 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TMEM87BQ96K49 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TMEM87BQ96K49 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TMEM87BQ96K49 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TMEM87BQ96K49 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TMEM87BQ96K49 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TMEM87BQ96K49 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
TMEM87BQ96K49 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TMEM87BQ96K49 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TMEM87BQ96K49 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TMEM87BQ96K49 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TMEM87BQ96K49 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TMEM87BQ96K49 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TMEM87BQ96K49 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TMEM87BQ96K49 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TMEM87BQ96K49 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TMEM87BQ96K49 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TMEM87BQ96K49 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
TMEM87BQ96K49 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TMEM87BQ96K49 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TMEM87BQ96K49 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TMEM87BQ96K49 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TMEM87BQ96K49 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TMEM87BQ96K49 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TMEM87BQ96K49 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TMEM87BQ96K49 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TMEM87BQ96K49 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TMEM87BQ96K49 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TMEM87BQ96K49 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TMEM87BQ96K49 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TMEM87BQ96K49 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TMEM87BQ96K49 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TMEM87BQ96K49 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
TMEM87BQ96K49 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
TMEM87BQ96K49 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TMEM87BQ96K49 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
TMEM87BQ96K49 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
TMEM87BQ96K49 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TMEM87BQ96K49 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TMEM87BQ96K49 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TMEM87BQ96K49 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TMEM87BQ96K49 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TMEM87BQ96K49 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TMEM87BQ96K49 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TMEM87BQ96K49 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TMEM87BQ96K49 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TMEM87BQ96K49 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
TMEM87BQ96K49 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TMEM87BQ96K49 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TMEM87BQ96K49 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TMEM87BQ96K49 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TMEM87BQ96K49 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TMEM87BQ96K49 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TMEM87BQ96K49 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TMEM87BQ96K49 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
TMEM87BQ96K49 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TMEM87BQ96K49 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TMEM87BQ96K49 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TMEM87BQ96K49 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
TMEM87BQ96K49 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TMEM87BQ96K49 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
TMEM87BQ96K49 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
TMEM87BQ96K49 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
TMEM87BQ96K49 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
TMEM87BQ96K49 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TMEM87BQ96K49 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TMEM87BQ96K49 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TMEM87BQ96K49 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TMEM87BQ96K49 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TMEM87BQ96K49 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TMEM87BQ96K49 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TMEM87BQ96K49 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TMEM87BQ96K49 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TMEM87BQ96K49 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TMEM87BQ96K49 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TMEM87BQ96K49 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TMEM87BQ96K49 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TMEM87BQ96K49 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TMEM87BQ96K49 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TMEM87BQ96K49 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TMEM87BQ96K49 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TMEM87BQ96K49 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.6 ms