Protein–RNA interactions for Protein: Q96JN8

NEURL4, Neuralized-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,562 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEURL4Q96JN8 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC30.75■■■□□ 2.51
NEURL4Q96JN8 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
NEURL4Q96JN8 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.75■■■□□ 2.51
NEURL4Q96JN8 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
NEURL4Q96JN8 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
NEURL4Q96JN8 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC30.75■■■□□ 2.51
NEURL4Q96JN8 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
NEURL4Q96JN8 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.75■■■□□ 2.51
NEURL4Q96JN8 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
NEURL4Q96JN8 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC30.75■■■□□ 2.51
NEURL4Q96JN8 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
NEURL4Q96JN8 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
NEURL4Q96JN8 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
NEURL4Q96JN8 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
NEURL4Q96JN8 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC30.75■■■□□ 2.51
NEURL4Q96JN8 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.75■■■□□ 2.51
NEURL4Q96JN8 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC30.75■■■□□ 2.51
NEURL4Q96JN8 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC30.75■■■□□ 2.51
NEURL4Q96JN8 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC30.75■■■□□ 2.51
NEURL4Q96JN8 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
NEURL4Q96JN8 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC30.75■■■□□ 2.51
NEURL4Q96JN8 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC30.75■■■□□ 2.51
NEURL4Q96JN8 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
NEURL4Q96JN8 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC30.74■■■□□ 2.51
NEURL4Q96JN8 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC30.74■■■□□ 2.51
NEURL4Q96JN8 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC30.74■■■□□ 2.51
NEURL4Q96JN8 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
NEURL4Q96JN8 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC30.74■■■□□ 2.51
NEURL4Q96JN8 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC30.74■■■□□ 2.51
NEURL4Q96JN8 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC30.74■■■□□ 2.51
NEURL4Q96JN8 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
NEURL4Q96JN8 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
NEURL4Q96JN8 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC30.73■■■□□ 2.51
NEURL4Q96JN8 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
NEURL4Q96JN8 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
NEURL4Q96JN8 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
NEURL4Q96JN8 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC30.73■■■□□ 2.51
NEURL4Q96JN8 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC30.73■■■□□ 2.51
NEURL4Q96JN8 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC30.73■■■□□ 2.51
NEURL4Q96JN8 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC30.73■■■□□ 2.51
NEURL4Q96JN8 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
NEURL4Q96JN8 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
NEURL4Q96JN8 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
NEURL4Q96JN8 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
NEURL4Q96JN8 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
NEURL4Q96JN8 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC30.72■■■□□ 2.51
NEURL4Q96JN8 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC30.72■■■□□ 2.51
NEURL4Q96JN8 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC30.72■■■□□ 2.51
NEURL4Q96JN8 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.72■■■□□ 2.51
NEURL4Q96JN8 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC30.72■■■□□ 2.51
NEURL4Q96JN8 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
NEURL4Q96JN8 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
NEURL4Q96JN8 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
NEURL4Q96JN8 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
NEURL4Q96JN8 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
NEURL4Q96JN8 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
NEURL4Q96JN8 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.71■■■□□ 2.51
NEURL4Q96JN8 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
NEURL4Q96JN8 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
NEURL4Q96JN8 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC30.71■■■□□ 2.51
NEURL4Q96JN8 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC30.71■■■□□ 2.51
NEURL4Q96JN8 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC30.71■■■□□ 2.51
NEURL4Q96JN8 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
NEURL4Q96JN8 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
NEURL4Q96JN8 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
NEURL4Q96JN8 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.71■■■□□ 2.51
NEURL4Q96JN8 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
NEURL4Q96JN8 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
NEURL4Q96JN8 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC30.71■■■□□ 2.51
NEURL4Q96JN8 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
NEURL4Q96JN8 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
NEURL4Q96JN8 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
NEURL4Q96JN8 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
NEURL4Q96JN8 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
NEURL4Q96JN8 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.7■■■□□ 2.51
NEURL4Q96JN8 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
NEURL4Q96JN8 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
NEURL4Q96JN8 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC30.7■■■□□ 2.5
NEURL4Q96JN8 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC30.7■■■□□ 2.5
NEURL4Q96JN8 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC30.7■■■□□ 2.5
NEURL4Q96JN8 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
NEURL4Q96JN8 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
NEURL4Q96JN8 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
NEURL4Q96JN8 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
NEURL4Q96JN8 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC30.69■■■□□ 2.5
NEURL4Q96JN8 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC30.69■■■□□ 2.5
NEURL4Q96JN8 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC30.69■■■□□ 2.5
NEURL4Q96JN8 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC30.69■■■□□ 2.5
NEURL4Q96JN8 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
NEURL4Q96JN8 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
NEURL4Q96JN8 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
NEURL4Q96JN8 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC30.68■■■□□ 2.5
NEURL4Q96JN8 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.68■■■□□ 2.5
NEURL4Q96JN8 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
NEURL4Q96JN8 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC30.68■■■□□ 2.5
NEURL4Q96JN8 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
NEURL4Q96JN8 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
NEURL4Q96JN8 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC30.68■■■□□ 2.5
NEURL4Q96JN8 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
NEURL4Q96JN8 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC30.68■■■□□ 2.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms