Protein–RNA interactions for Protein: Q96JM3

CHAMP1, Chromosome alignment-maintaining phosphoprotein 1, humanhuman

Predictions only

Length 812 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAMP1Q96JM3 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CHAMP1Q96JM3 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CHAMP1Q96JM3 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CHAMP1Q96JM3 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CHAMP1Q96JM3 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CHAMP1Q96JM3 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CHAMP1Q96JM3 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CHAMP1Q96JM3 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CHAMP1Q96JM3 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CHAMP1Q96JM3 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CHAMP1Q96JM3 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CHAMP1Q96JM3 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CHAMP1Q96JM3 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CHAMP1Q96JM3 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CHAMP1Q96JM3 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CHAMP1Q96JM3 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CHAMP1Q96JM3 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CHAMP1Q96JM3 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CHAMP1Q96JM3 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CHAMP1Q96JM3 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CHAMP1Q96JM3 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CHAMP1Q96JM3 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CHAMP1Q96JM3 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CHAMP1Q96JM3 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CHAMP1Q96JM3 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CHAMP1Q96JM3 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CHAMP1Q96JM3 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CHAMP1Q96JM3 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CHAMP1Q96JM3 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CHAMP1Q96JM3 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CHAMP1Q96JM3 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CHAMP1Q96JM3 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CHAMP1Q96JM3 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CHAMP1Q96JM3 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CHAMP1Q96JM3 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CHAMP1Q96JM3 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CHAMP1Q96JM3 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CHAMP1Q96JM3 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CHAMP1Q96JM3 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CHAMP1Q96JM3 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CHAMP1Q96JM3 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CHAMP1Q96JM3 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CHAMP1Q96JM3 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CHAMP1Q96JM3 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CHAMP1Q96JM3 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CHAMP1Q96JM3 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CHAMP1Q96JM3 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CHAMP1Q96JM3 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CHAMP1Q96JM3 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CHAMP1Q96JM3 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CHAMP1Q96JM3 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CHAMP1Q96JM3 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CHAMP1Q96JM3 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
CHAMP1Q96JM3 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CHAMP1Q96JM3 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
CHAMP1Q96JM3 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CHAMP1Q96JM3 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CHAMP1Q96JM3 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CHAMP1Q96JM3 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CHAMP1Q96JM3 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CHAMP1Q96JM3 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CHAMP1Q96JM3 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CHAMP1Q96JM3 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
CHAMP1Q96JM3 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CHAMP1Q96JM3 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CHAMP1Q96JM3 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CHAMP1Q96JM3 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CHAMP1Q96JM3 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
CHAMP1Q96JM3 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CHAMP1Q96JM3 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CHAMP1Q96JM3 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CHAMP1Q96JM3 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CHAMP1Q96JM3 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CHAMP1Q96JM3 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CHAMP1Q96JM3 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CHAMP1Q96JM3 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CHAMP1Q96JM3 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CHAMP1Q96JM3 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CHAMP1Q96JM3 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CHAMP1Q96JM3 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CHAMP1Q96JM3 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CHAMP1Q96JM3 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CHAMP1Q96JM3 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CHAMP1Q96JM3 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CHAMP1Q96JM3 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CHAMP1Q96JM3 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CHAMP1Q96JM3 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CHAMP1Q96JM3 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CHAMP1Q96JM3 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CHAMP1Q96JM3 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CHAMP1Q96JM3 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CHAMP1Q96JM3 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CHAMP1Q96JM3 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CHAMP1Q96JM3 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CHAMP1Q96JM3 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CHAMP1Q96JM3 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CHAMP1Q96JM3 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CHAMP1Q96JM3 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CHAMP1Q96JM3 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CHAMP1Q96JM3 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms