Protein–RNA interactions for Protein: Q96J77

TPD52L3, Tumor protein D55, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPD52L3Q96J77 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
TPD52L3Q96J77 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TPD52L3Q96J77 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TPD52L3Q96J77 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
TPD52L3Q96J77 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
TPD52L3Q96J77 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TPD52L3Q96J77 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TPD52L3Q96J77 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TPD52L3Q96J77 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TPD52L3Q96J77 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TPD52L3Q96J77 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
TPD52L3Q96J77 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
TPD52L3Q96J77 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
TPD52L3Q96J77 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
TPD52L3Q96J77 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TPD52L3Q96J77 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TPD52L3Q96J77 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TPD52L3Q96J77 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TPD52L3Q96J77 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
TPD52L3Q96J77 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
TPD52L3Q96J77 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
TPD52L3Q96J77 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TPD52L3Q96J77 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
TPD52L3Q96J77 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
TPD52L3Q96J77 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
TPD52L3Q96J77 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
TPD52L3Q96J77 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TPD52L3Q96J77 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TPD52L3Q96J77 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
TPD52L3Q96J77 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TPD52L3Q96J77 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TPD52L3Q96J77 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TPD52L3Q96J77 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TPD52L3Q96J77 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TPD52L3Q96J77 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
TPD52L3Q96J77 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TPD52L3Q96J77 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TPD52L3Q96J77 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
TPD52L3Q96J77 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TPD52L3Q96J77 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TPD52L3Q96J77 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
TPD52L3Q96J77 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
TPD52L3Q96J77 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TPD52L3Q96J77 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
TPD52L3Q96J77 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TPD52L3Q96J77 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TPD52L3Q96J77 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TPD52L3Q96J77 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TPD52L3Q96J77 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TPD52L3Q96J77 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TPD52L3Q96J77 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TPD52L3Q96J77 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TPD52L3Q96J77 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TPD52L3Q96J77 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
TPD52L3Q96J77 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TPD52L3Q96J77 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TPD52L3Q96J77 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
TPD52L3Q96J77 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
TPD52L3Q96J77 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TPD52L3Q96J77 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TPD52L3Q96J77 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TPD52L3Q96J77 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TPD52L3Q96J77 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
TPD52L3Q96J77 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC19.68■□□□□ 0.74
TPD52L3Q96J77 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TPD52L3Q96J77 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TPD52L3Q96J77 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
TPD52L3Q96J77 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TPD52L3Q96J77 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC19.68■□□□□ 0.74
TPD52L3Q96J77 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
TPD52L3Q96J77 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TPD52L3Q96J77 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
TPD52L3Q96J77 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TPD52L3Q96J77 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC19.68■□□□□ 0.74
TPD52L3Q96J77 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
TPD52L3Q96J77 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TPD52L3Q96J77 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
TPD52L3Q96J77 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TPD52L3Q96J77 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TPD52L3Q96J77 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
TPD52L3Q96J77 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
TPD52L3Q96J77 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
TPD52L3Q96J77 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
TPD52L3Q96J77 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
TPD52L3Q96J77 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
TPD52L3Q96J77 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
TPD52L3Q96J77 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
TPD52L3Q96J77 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
TPD52L3Q96J77 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
TPD52L3Q96J77 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
TPD52L3Q96J77 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
TPD52L3Q96J77 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
TPD52L3Q96J77 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
TPD52L3Q96J77 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
TPD52L3Q96J77 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
TPD52L3Q96J77 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
TPD52L3Q96J77 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
TPD52L3Q96J77 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
TPD52L3Q96J77 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
TPD52L3Q96J77 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms