Protein–RNA interactions for Protein: Q96GY3

LIN37, Protein lin-37 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIN37Q96GY3 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LIN37Q96GY3 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LIN37Q96GY3 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
LIN37Q96GY3 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LIN37Q96GY3 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LIN37Q96GY3 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LIN37Q96GY3 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LIN37Q96GY3 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LIN37Q96GY3 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LIN37Q96GY3 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LIN37Q96GY3 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LIN37Q96GY3 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LIN37Q96GY3 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LIN37Q96GY3 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LIN37Q96GY3 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LIN37Q96GY3 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LIN37Q96GY3 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LIN37Q96GY3 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LIN37Q96GY3 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LIN37Q96GY3 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LIN37Q96GY3 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LIN37Q96GY3 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LIN37Q96GY3 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
LIN37Q96GY3 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LIN37Q96GY3 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LIN37Q96GY3 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LIN37Q96GY3 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LIN37Q96GY3 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LIN37Q96GY3 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LIN37Q96GY3 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LIN37Q96GY3 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LIN37Q96GY3 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LIN37Q96GY3 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
LIN37Q96GY3 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LIN37Q96GY3 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
LIN37Q96GY3 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LIN37Q96GY3 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LIN37Q96GY3 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LIN37Q96GY3 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LIN37Q96GY3 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LIN37Q96GY3 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LIN37Q96GY3 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
LIN37Q96GY3 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LIN37Q96GY3 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
LIN37Q96GY3 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LIN37Q96GY3 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LIN37Q96GY3 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LIN37Q96GY3 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LIN37Q96GY3 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LIN37Q96GY3 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
LIN37Q96GY3 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
LIN37Q96GY3 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
LIN37Q96GY3 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
LIN37Q96GY3 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
LIN37Q96GY3 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
LIN37Q96GY3 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
LIN37Q96GY3 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
LIN37Q96GY3 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
LIN37Q96GY3 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
LIN37Q96GY3 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
LIN37Q96GY3 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
LIN37Q96GY3 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LIN37Q96GY3 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LIN37Q96GY3 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LIN37Q96GY3 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LIN37Q96GY3 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LIN37Q96GY3 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LIN37Q96GY3 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LIN37Q96GY3 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LIN37Q96GY3 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LIN37Q96GY3 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LIN37Q96GY3 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LIN37Q96GY3 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LIN37Q96GY3 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LIN37Q96GY3 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LIN37Q96GY3 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LIN37Q96GY3 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
LIN37Q96GY3 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
LIN37Q96GY3 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LIN37Q96GY3 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LIN37Q96GY3 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
LIN37Q96GY3 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
LIN37Q96GY3 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LIN37Q96GY3 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
LIN37Q96GY3 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
LIN37Q96GY3 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
LIN37Q96GY3 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
LIN37Q96GY3 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LIN37Q96GY3 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LIN37Q96GY3 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LIN37Q96GY3 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
LIN37Q96GY3 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
LIN37Q96GY3 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
LIN37Q96GY3 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
LIN37Q96GY3 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
LIN37Q96GY3 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
LIN37Q96GY3 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
LIN37Q96GY3 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
LIN37Q96GY3 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
LIN37Q96GY3 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms