Protein–RNA interactions for Protein: Q96CX2

KCTD12, BTB/POZ domain-containing protein KCTD12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCTD12Q96CX2 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
KCTD12Q96CX2 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
KCTD12Q96CX2 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
KCTD12Q96CX2 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
KCTD12Q96CX2 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
KCTD12Q96CX2 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
KCTD12Q96CX2 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
KCTD12Q96CX2 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
KCTD12Q96CX2 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
KCTD12Q96CX2 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
KCTD12Q96CX2 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
KCTD12Q96CX2 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
KCTD12Q96CX2 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
KCTD12Q96CX2 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
KCTD12Q96CX2 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
KCTD12Q96CX2 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
KCTD12Q96CX2 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
KCTD12Q96CX2 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
KCTD12Q96CX2 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
KCTD12Q96CX2 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
KCTD12Q96CX2 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
KCTD12Q96CX2 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
KCTD12Q96CX2 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
KCTD12Q96CX2 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KCTD12Q96CX2 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KCTD12Q96CX2 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KCTD12Q96CX2 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KCTD12Q96CX2 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
KCTD12Q96CX2 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
KCTD12Q96CX2 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
KCTD12Q96CX2 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
KCTD12Q96CX2 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KCTD12Q96CX2 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KCTD12Q96CX2 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
KCTD12Q96CX2 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KCTD12Q96CX2 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
KCTD12Q96CX2 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
KCTD12Q96CX2 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
KCTD12Q96CX2 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
KCTD12Q96CX2 AL589935.2-201ENST00000616471 1231 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
KCTD12Q96CX2 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
KCTD12Q96CX2 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KCTD12Q96CX2 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KCTD12Q96CX2 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KCTD12Q96CX2 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KCTD12Q96CX2 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KCTD12Q96CX2 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KCTD12Q96CX2 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
KCTD12Q96CX2 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KCTD12Q96CX2 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KCTD12Q96CX2 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
KCTD12Q96CX2 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KCTD12Q96CX2 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
KCTD12Q96CX2 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KCTD12Q96CX2 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KCTD12Q96CX2 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KCTD12Q96CX2 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KCTD12Q96CX2 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
KCTD12Q96CX2 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KCTD12Q96CX2 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
KCTD12Q96CX2 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
KCTD12Q96CX2 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
KCTD12Q96CX2 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KCTD12Q96CX2 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KCTD12Q96CX2 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KCTD12Q96CX2 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
KCTD12Q96CX2 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KCTD12Q96CX2 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KCTD12Q96CX2 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
KCTD12Q96CX2 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KCTD12Q96CX2 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KCTD12Q96CX2 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KCTD12Q96CX2 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KCTD12Q96CX2 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KCTD12Q96CX2 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KCTD12Q96CX2 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KCTD12Q96CX2 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KCTD12Q96CX2 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KCTD12Q96CX2 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KCTD12Q96CX2 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KCTD12Q96CX2 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KCTD12Q96CX2 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KCTD12Q96CX2 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
KCTD12Q96CX2 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KCTD12Q96CX2 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KCTD12Q96CX2 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KCTD12Q96CX2 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KCTD12Q96CX2 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KCTD12Q96CX2 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KCTD12Q96CX2 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KCTD12Q96CX2 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KCTD12Q96CX2 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KCTD12Q96CX2 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KCTD12Q96CX2 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
KCTD12Q96CX2 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KCTD12Q96CX2 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KCTD12Q96CX2 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KCTD12Q96CX2 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
KCTD12Q96CX2 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
KCTD12Q96CX2 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms