Protein–RNA interactions for Protein: Q96CT7

CCDC124, Coiled-coil domain-containing protein 124, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 223 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC124Q96CT7 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
CCDC124Q96CT7 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
CCDC124Q96CT7 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC124Q96CT7 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC124Q96CT7 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC124Q96CT7 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC124Q96CT7 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC124Q96CT7 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC124Q96CT7 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC124Q96CT7 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC124Q96CT7 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC124Q96CT7 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC124Q96CT7 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC124Q96CT7 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC124Q96CT7 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC124Q96CT7 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC124Q96CT7 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC124Q96CT7 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC124Q96CT7 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC124Q96CT7 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC124Q96CT7 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC124Q96CT7 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC124Q96CT7 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC124Q96CT7 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC124Q96CT7 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC124Q96CT7 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC124Q96CT7 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC124Q96CT7 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC124Q96CT7 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC124Q96CT7 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC124Q96CT7 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC124Q96CT7 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC124Q96CT7 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC124Q96CT7 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC124Q96CT7 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC124Q96CT7 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC124Q96CT7 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC124Q96CT7 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC124Q96CT7 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC124Q96CT7 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC124Q96CT7 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC124Q96CT7 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC124Q96CT7 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC124Q96CT7 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC124Q96CT7 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC124Q96CT7 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC124Q96CT7 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC124Q96CT7 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC124Q96CT7 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC124Q96CT7 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC124Q96CT7 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC124Q96CT7 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC124Q96CT7 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC124Q96CT7 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC124Q96CT7 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC124Q96CT7 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC124Q96CT7 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC124Q96CT7 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC124Q96CT7 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC124Q96CT7 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC124Q96CT7 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC124Q96CT7 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC124Q96CT7 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC124Q96CT7 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC124Q96CT7 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC124Q96CT7 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC124Q96CT7 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC124Q96CT7 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC124Q96CT7 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC124Q96CT7 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC124Q96CT7 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC124Q96CT7 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC124Q96CT7 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC124Q96CT7 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC124Q96CT7 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC124Q96CT7 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC124Q96CT7 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC124Q96CT7 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC124Q96CT7 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC124Q96CT7 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC124Q96CT7 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC124Q96CT7 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC124Q96CT7 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC124Q96CT7 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC124Q96CT7 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC124Q96CT7 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC124Q96CT7 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC124Q96CT7 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC124Q96CT7 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC124Q96CT7 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC124Q96CT7 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC124Q96CT7 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC124Q96CT7 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC124Q96CT7 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC124Q96CT7 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC124Q96CT7 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC124Q96CT7 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC124Q96CT7 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC124Q96CT7 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC124Q96CT7 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms