Protein–RNA interactions for Protein: Q96BQ1

FAM3D, Protein FAM3D, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3DQ96BQ1 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FAM3DQ96BQ1 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
FAM3DQ96BQ1 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
FAM3DQ96BQ1 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FAM3DQ96BQ1 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
FAM3DQ96BQ1 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
FAM3DQ96BQ1 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FAM3DQ96BQ1 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FAM3DQ96BQ1 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FAM3DQ96BQ1 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
FAM3DQ96BQ1 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FAM3DQ96BQ1 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FAM3DQ96BQ1 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
FAM3DQ96BQ1 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
FAM3DQ96BQ1 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
FAM3DQ96BQ1 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
FAM3DQ96BQ1 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
FAM3DQ96BQ1 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
FAM3DQ96BQ1 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FAM3DQ96BQ1 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
FAM3DQ96BQ1 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FAM3DQ96BQ1 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FAM3DQ96BQ1 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
FAM3DQ96BQ1 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FAM3DQ96BQ1 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
FAM3DQ96BQ1 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FAM3DQ96BQ1 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FAM3DQ96BQ1 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
FAM3DQ96BQ1 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FAM3DQ96BQ1 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FAM3DQ96BQ1 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FAM3DQ96BQ1 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FAM3DQ96BQ1 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FAM3DQ96BQ1 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
FAM3DQ96BQ1 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FAM3DQ96BQ1 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
FAM3DQ96BQ1 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
FAM3DQ96BQ1 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FAM3DQ96BQ1 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FAM3DQ96BQ1 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
FAM3DQ96BQ1 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FAM3DQ96BQ1 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FAM3DQ96BQ1 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
FAM3DQ96BQ1 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
FAM3DQ96BQ1 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
FAM3DQ96BQ1 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FAM3DQ96BQ1 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FAM3DQ96BQ1 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FAM3DQ96BQ1 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FAM3DQ96BQ1 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
FAM3DQ96BQ1 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
FAM3DQ96BQ1 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
FAM3DQ96BQ1 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
FAM3DQ96BQ1 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
FAM3DQ96BQ1 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
FAM3DQ96BQ1 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
FAM3DQ96BQ1 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
FAM3DQ96BQ1 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
FAM3DQ96BQ1 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
FAM3DQ96BQ1 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
FAM3DQ96BQ1 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
FAM3DQ96BQ1 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
FAM3DQ96BQ1 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
FAM3DQ96BQ1 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
FAM3DQ96BQ1 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
FAM3DQ96BQ1 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
FAM3DQ96BQ1 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
FAM3DQ96BQ1 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
FAM3DQ96BQ1 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
FAM3DQ96BQ1 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
FAM3DQ96BQ1 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
FAM3DQ96BQ1 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
FAM3DQ96BQ1 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
FAM3DQ96BQ1 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FAM3DQ96BQ1 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
FAM3DQ96BQ1 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
FAM3DQ96BQ1 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
FAM3DQ96BQ1 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FAM3DQ96BQ1 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
FAM3DQ96BQ1 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
FAM3DQ96BQ1 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FAM3DQ96BQ1 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
FAM3DQ96BQ1 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
FAM3DQ96BQ1 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FAM3DQ96BQ1 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
FAM3DQ96BQ1 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FAM3DQ96BQ1 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
FAM3DQ96BQ1 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
FAM3DQ96BQ1 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
FAM3DQ96BQ1 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
FAM3DQ96BQ1 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
FAM3DQ96BQ1 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
FAM3DQ96BQ1 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
FAM3DQ96BQ1 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
FAM3DQ96BQ1 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
FAM3DQ96BQ1 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FAM3DQ96BQ1 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FAM3DQ96BQ1 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FAM3DQ96BQ1 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FAM3DQ96BQ1 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
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