Protein–RNA interactions for Protein: Q96BF3

TMIGD2, Transmembrane and immunoglobulin domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD2Q96BF3 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
TMIGD2Q96BF3 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
TMIGD2Q96BF3 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TMIGD2Q96BF3 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
TMIGD2Q96BF3 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TMIGD2Q96BF3 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
TMIGD2Q96BF3 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TMIGD2Q96BF3 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TMIGD2Q96BF3 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
TMIGD2Q96BF3 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TMIGD2Q96BF3 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TMIGD2Q96BF3 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
TMIGD2Q96BF3 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC19.4■□□□□ 0.7
TMIGD2Q96BF3 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TMIGD2Q96BF3 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TMIGD2Q96BF3 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TMIGD2Q96BF3 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TMIGD2Q96BF3 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
TMIGD2Q96BF3 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TMIGD2Q96BF3 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
TMIGD2Q96BF3 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TMIGD2Q96BF3 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
TMIGD2Q96BF3 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.7
TMIGD2Q96BF3 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.7
TMIGD2Q96BF3 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
TMIGD2Q96BF3 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TMIGD2Q96BF3 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
TMIGD2Q96BF3 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
TMIGD2Q96BF3 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
TMIGD2Q96BF3 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
TMIGD2Q96BF3 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TMIGD2Q96BF3 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TMIGD2Q96BF3 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TMIGD2Q96BF3 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
TMIGD2Q96BF3 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TMIGD2Q96BF3 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TMIGD2Q96BF3 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TMIGD2Q96BF3 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TMIGD2Q96BF3 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TMIGD2Q96BF3 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TMIGD2Q96BF3 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TMIGD2Q96BF3 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
TMIGD2Q96BF3 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
TMIGD2Q96BF3 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TMIGD2Q96BF3 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
TMIGD2Q96BF3 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
TMIGD2Q96BF3 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
TMIGD2Q96BF3 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
TMIGD2Q96BF3 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TMIGD2Q96BF3 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
TMIGD2Q96BF3 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
TMIGD2Q96BF3 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TMIGD2Q96BF3 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TMIGD2Q96BF3 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TMIGD2Q96BF3 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TMIGD2Q96BF3 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
TMIGD2Q96BF3 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TMIGD2Q96BF3 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TMIGD2Q96BF3 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TMIGD2Q96BF3 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TMIGD2Q96BF3 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
TMIGD2Q96BF3 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TMIGD2Q96BF3 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TMIGD2Q96BF3 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TMIGD2Q96BF3 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TMIGD2Q96BF3 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TMIGD2Q96BF3 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TMIGD2Q96BF3 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TMIGD2Q96BF3 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TMIGD2Q96BF3 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TMIGD2Q96BF3 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TMIGD2Q96BF3 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TMIGD2Q96BF3 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TMIGD2Q96BF3 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TMIGD2Q96BF3 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TMIGD2Q96BF3 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TMIGD2Q96BF3 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TMIGD2Q96BF3 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TMIGD2Q96BF3 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TMIGD2Q96BF3 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TMIGD2Q96BF3 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TMIGD2Q96BF3 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TMIGD2Q96BF3 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TMIGD2Q96BF3 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TMIGD2Q96BF3 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TMIGD2Q96BF3 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TMIGD2Q96BF3 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TMIGD2Q96BF3 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TMIGD2Q96BF3 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TMIGD2Q96BF3 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TMIGD2Q96BF3 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TMIGD2Q96BF3 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TMIGD2Q96BF3 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TMIGD2Q96BF3 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TMIGD2Q96BF3 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TMIGD2Q96BF3 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TMIGD2Q96BF3 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TMIGD2Q96BF3 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TMIGD2Q96BF3 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TMIGD2Q96BF3 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms