Protein–RNA interactions for Protein: Q96B26

EXOSC8, Exosome complex component RRP43, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC8Q96B26 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
EXOSC8Q96B26 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
EXOSC8Q96B26 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
EXOSC8Q96B26 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
EXOSC8Q96B26 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
EXOSC8Q96B26 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
EXOSC8Q96B26 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
EXOSC8Q96B26 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
EXOSC8Q96B26 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
EXOSC8Q96B26 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
EXOSC8Q96B26 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
EXOSC8Q96B26 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
EXOSC8Q96B26 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
EXOSC8Q96B26 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC19.97■□□□□ 0.79
EXOSC8Q96B26 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
EXOSC8Q96B26 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
EXOSC8Q96B26 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
EXOSC8Q96B26 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
EXOSC8Q96B26 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
EXOSC8Q96B26 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
EXOSC8Q96B26 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
EXOSC8Q96B26 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
EXOSC8Q96B26 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
EXOSC8Q96B26 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
EXOSC8Q96B26 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
EXOSC8Q96B26 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
EXOSC8Q96B26 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
EXOSC8Q96B26 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.96■□□□□ 0.79
EXOSC8Q96B26 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
EXOSC8Q96B26 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
EXOSC8Q96B26 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
EXOSC8Q96B26 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
EXOSC8Q96B26 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
EXOSC8Q96B26 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
EXOSC8Q96B26 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
EXOSC8Q96B26 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
EXOSC8Q96B26 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
EXOSC8Q96B26 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
EXOSC8Q96B26 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
EXOSC8Q96B26 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
EXOSC8Q96B26 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
EXOSC8Q96B26 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC19.96■□□□□ 0.79
EXOSC8Q96B26 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
EXOSC8Q96B26 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
EXOSC8Q96B26 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
EXOSC8Q96B26 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
EXOSC8Q96B26 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
EXOSC8Q96B26 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
EXOSC8Q96B26 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
EXOSC8Q96B26 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
EXOSC8Q96B26 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
EXOSC8Q96B26 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
EXOSC8Q96B26 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
EXOSC8Q96B26 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
EXOSC8Q96B26 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
EXOSC8Q96B26 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
EXOSC8Q96B26 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
EXOSC8Q96B26 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
EXOSC8Q96B26 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
EXOSC8Q96B26 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
EXOSC8Q96B26 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
EXOSC8Q96B26 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
EXOSC8Q96B26 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
EXOSC8Q96B26 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
EXOSC8Q96B26 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
EXOSC8Q96B26 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
EXOSC8Q96B26 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
EXOSC8Q96B26 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
EXOSC8Q96B26 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
EXOSC8Q96B26 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
EXOSC8Q96B26 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
EXOSC8Q96B26 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
EXOSC8Q96B26 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
EXOSC8Q96B26 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
EXOSC8Q96B26 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
EXOSC8Q96B26 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
EXOSC8Q96B26 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
EXOSC8Q96B26 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
EXOSC8Q96B26 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
EXOSC8Q96B26 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
EXOSC8Q96B26 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
EXOSC8Q96B26 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
EXOSC8Q96B26 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
EXOSC8Q96B26 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
EXOSC8Q96B26 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
EXOSC8Q96B26 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
EXOSC8Q96B26 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
EXOSC8Q96B26 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
EXOSC8Q96B26 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
EXOSC8Q96B26 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
EXOSC8Q96B26 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
EXOSC8Q96B26 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
EXOSC8Q96B26 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
EXOSC8Q96B26 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
EXOSC8Q96B26 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
EXOSC8Q96B26 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
EXOSC8Q96B26 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
EXOSC8Q96B26 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
EXOSC8Q96B26 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
EXOSC8Q96B26 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms