Protein–RNA interactions for Protein: Q969K3

RNF34, E3 ubiquitin-protein ligase RNF34, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF34Q969K3 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RNF34Q969K3 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RNF34Q969K3 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RNF34Q969K3 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RNF34Q969K3 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RNF34Q969K3 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RNF34Q969K3 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
RNF34Q969K3 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RNF34Q969K3 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RNF34Q969K3 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RNF34Q969K3 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RNF34Q969K3 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RNF34Q969K3 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RNF34Q969K3 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RNF34Q969K3 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RNF34Q969K3 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RNF34Q969K3 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RNF34Q969K3 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RNF34Q969K3 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RNF34Q969K3 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
RNF34Q969K3 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RNF34Q969K3 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RNF34Q969K3 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
RNF34Q969K3 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RNF34Q969K3 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RNF34Q969K3 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RNF34Q969K3 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
RNF34Q969K3 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RNF34Q969K3 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RNF34Q969K3 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RNF34Q969K3 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RNF34Q969K3 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RNF34Q969K3 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RNF34Q969K3 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RNF34Q969K3 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RNF34Q969K3 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RNF34Q969K3 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RNF34Q969K3 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RNF34Q969K3 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RNF34Q969K3 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RNF34Q969K3 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RNF34Q969K3 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RNF34Q969K3 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RNF34Q969K3 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RNF34Q969K3 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RNF34Q969K3 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RNF34Q969K3 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RNF34Q969K3 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
RNF34Q969K3 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
RNF34Q969K3 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
RNF34Q969K3 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
RNF34Q969K3 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RNF34Q969K3 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RNF34Q969K3 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RNF34Q969K3 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RNF34Q969K3 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RNF34Q969K3 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RNF34Q969K3 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RNF34Q969K3 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
RNF34Q969K3 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RNF34Q969K3 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RNF34Q969K3 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RNF34Q969K3 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RNF34Q969K3 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RNF34Q969K3 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RNF34Q969K3 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RNF34Q969K3 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RNF34Q969K3 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RNF34Q969K3 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
RNF34Q969K3 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RNF34Q969K3 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RNF34Q969K3 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
RNF34Q969K3 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
RNF34Q969K3 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC22■■□□□ 1.11
RNF34Q969K3 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RNF34Q969K3 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
RNF34Q969K3 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RNF34Q969K3 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RNF34Q969K3 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RNF34Q969K3 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RNF34Q969K3 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RNF34Q969K3 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RNF34Q969K3 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RNF34Q969K3 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
RNF34Q969K3 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RNF34Q969K3 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RNF34Q969K3 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RNF34Q969K3 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RNF34Q969K3 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RNF34Q969K3 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RNF34Q969K3 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RNF34Q969K3 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RNF34Q969K3 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RNF34Q969K3 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RNF34Q969K3 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RNF34Q969K3 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RNF34Q969K3 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RNF34Q969K3 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RNF34Q969K3 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RNF34Q969K3 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms