Protein–RNA interactions for Protein: Q93038

TNFRSF25, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 25, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF25Q93038 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TNFRSF25Q93038 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TNFRSF25Q93038 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
TNFRSF25Q93038 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TNFRSF25Q93038 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TNFRSF25Q93038 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TNFRSF25Q93038 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TNFRSF25Q93038 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TNFRSF25Q93038 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TNFRSF25Q93038 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
TNFRSF25Q93038 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TNFRSF25Q93038 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
TNFRSF25Q93038 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TNFRSF25Q93038 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TNFRSF25Q93038 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TNFRSF25Q93038 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TNFRSF25Q93038 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TNFRSF25Q93038 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TNFRSF25Q93038 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TNFRSF25Q93038 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TNFRSF25Q93038 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
TNFRSF25Q93038 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TNFRSF25Q93038 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TNFRSF25Q93038 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TNFRSF25Q93038 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TNFRSF25Q93038 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TNFRSF25Q93038 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TNFRSF25Q93038 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TNFRSF25Q93038 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TNFRSF25Q93038 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TNFRSF25Q93038 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TNFRSF25Q93038 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TNFRSF25Q93038 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TNFRSF25Q93038 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TNFRSF25Q93038 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TNFRSF25Q93038 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TNFRSF25Q93038 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TNFRSF25Q93038 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TNFRSF25Q93038 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TNFRSF25Q93038 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TNFRSF25Q93038 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TNFRSF25Q93038 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TNFRSF25Q93038 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TNFRSF25Q93038 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
TNFRSF25Q93038 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TNFRSF25Q93038 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TNFRSF25Q93038 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TNFRSF25Q93038 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TNFRSF25Q93038 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TNFRSF25Q93038 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TNFRSF25Q93038 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TNFRSF25Q93038 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TNFRSF25Q93038 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TNFRSF25Q93038 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TNFRSF25Q93038 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TNFRSF25Q93038 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TNFRSF25Q93038 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TNFRSF25Q93038 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TNFRSF25Q93038 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
TNFRSF25Q93038 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TNFRSF25Q93038 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TNFRSF25Q93038 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TNFRSF25Q93038 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TNFRSF25Q93038 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TNFRSF25Q93038 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TNFRSF25Q93038 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TNFRSF25Q93038 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TNFRSF25Q93038 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TNFRSF25Q93038 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TNFRSF25Q93038 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TNFRSF25Q93038 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
TNFRSF25Q93038 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TNFRSF25Q93038 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TNFRSF25Q93038 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TNFRSF25Q93038 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TNFRSF25Q93038 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TNFRSF25Q93038 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TNFRSF25Q93038 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TNFRSF25Q93038 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TNFRSF25Q93038 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TNFRSF25Q93038 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TNFRSF25Q93038 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TNFRSF25Q93038 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TNFRSF25Q93038 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TNFRSF25Q93038 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TNFRSF25Q93038 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TNFRSF25Q93038 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TNFRSF25Q93038 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TNFRSF25Q93038 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TNFRSF25Q93038 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TNFRSF25Q93038 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TNFRSF25Q93038 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TNFRSF25Q93038 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TNFRSF25Q93038 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TNFRSF25Q93038 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TNFRSF25Q93038 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TNFRSF25Q93038 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TNFRSF25Q93038 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TNFRSF25Q93038 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TNFRSF25Q93038 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms