Protein–RNA interactions for Protein: Q92878

RAD50, DNA repair protein RAD50, humanhuman

Predictions only

Length 1,312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD50Q92878 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RAD50Q92878 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RAD50Q92878 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RAD50Q92878 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RAD50Q92878 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RAD50Q92878 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RAD50Q92878 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RAD50Q92878 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RAD50Q92878 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RAD50Q92878 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RAD50Q92878 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RAD50Q92878 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
RAD50Q92878 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RAD50Q92878 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RAD50Q92878 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RAD50Q92878 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RAD50Q92878 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
RAD50Q92878 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
RAD50Q92878 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
RAD50Q92878 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
RAD50Q92878 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
RAD50Q92878 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
RAD50Q92878 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RAD50Q92878 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RAD50Q92878 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RAD50Q92878 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RAD50Q92878 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RAD50Q92878 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RAD50Q92878 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RAD50Q92878 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RAD50Q92878 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RAD50Q92878 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RAD50Q92878 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RAD50Q92878 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RAD50Q92878 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RAD50Q92878 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RAD50Q92878 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RAD50Q92878 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RAD50Q92878 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RAD50Q92878 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RAD50Q92878 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RAD50Q92878 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RAD50Q92878 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RAD50Q92878 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RAD50Q92878 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RAD50Q92878 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RAD50Q92878 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RAD50Q92878 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RAD50Q92878 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RAD50Q92878 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RAD50Q92878 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RAD50Q92878 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RAD50Q92878 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RAD50Q92878 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RAD50Q92878 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RAD50Q92878 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RAD50Q92878 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RAD50Q92878 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RAD50Q92878 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RAD50Q92878 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
RAD50Q92878 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RAD50Q92878 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RAD50Q92878 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RAD50Q92878 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RAD50Q92878 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RAD50Q92878 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RAD50Q92878 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RAD50Q92878 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RAD50Q92878 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RAD50Q92878 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RAD50Q92878 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RAD50Q92878 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RAD50Q92878 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RAD50Q92878 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RAD50Q92878 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RAD50Q92878 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RAD50Q92878 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RAD50Q92878 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RAD50Q92878 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RAD50Q92878 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RAD50Q92878 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RAD50Q92878 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RAD50Q92878 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RAD50Q92878 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
RAD50Q92878 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
RAD50Q92878 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.64
RAD50Q92878 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.64
RAD50Q92878 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
RAD50Q92878 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC25.33■■□□□ 1.64
RAD50Q92878 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
RAD50Q92878 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
RAD50Q92878 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RAD50Q92878 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RAD50Q92878 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RAD50Q92878 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RAD50Q92878 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RAD50Q92878 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RAD50Q92878 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RAD50Q92878 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RAD50Q92878 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms