Protein–RNA interactions for Protein: Q92854

SEMA4D, Semaphorin-4D, humanhuman

Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4DQ92854 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SEMA4DQ92854 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SEMA4DQ92854 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SEMA4DQ92854 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SEMA4DQ92854 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SEMA4DQ92854 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SEMA4DQ92854 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SEMA4DQ92854 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SEMA4DQ92854 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SEMA4DQ92854 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SEMA4DQ92854 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SEMA4DQ92854 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SEMA4DQ92854 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SEMA4DQ92854 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SEMA4DQ92854 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SEMA4DQ92854 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SEMA4DQ92854 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SEMA4DQ92854 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SEMA4DQ92854 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SEMA4DQ92854 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SEMA4DQ92854 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SEMA4DQ92854 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SEMA4DQ92854 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SEMA4DQ92854 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SEMA4DQ92854 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SEMA4DQ92854 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SEMA4DQ92854 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SEMA4DQ92854 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SEMA4DQ92854 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SEMA4DQ92854 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SEMA4DQ92854 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SEMA4DQ92854 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SEMA4DQ92854 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SEMA4DQ92854 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SEMA4DQ92854 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SEMA4DQ92854 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SEMA4DQ92854 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SEMA4DQ92854 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SEMA4DQ92854 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SEMA4DQ92854 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SEMA4DQ92854 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SEMA4DQ92854 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SEMA4DQ92854 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SEMA4DQ92854 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SEMA4DQ92854 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SEMA4DQ92854 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
SEMA4DQ92854 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SEMA4DQ92854 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SEMA4DQ92854 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SEMA4DQ92854 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SEMA4DQ92854 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SEMA4DQ92854 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SEMA4DQ92854 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SEMA4DQ92854 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SEMA4DQ92854 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SEMA4DQ92854 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SEMA4DQ92854 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SEMA4DQ92854 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SEMA4DQ92854 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SEMA4DQ92854 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SEMA4DQ92854 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SEMA4DQ92854 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SEMA4DQ92854 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SEMA4DQ92854 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SEMA4DQ92854 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SEMA4DQ92854 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SEMA4DQ92854 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SEMA4DQ92854 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SEMA4DQ92854 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SEMA4DQ92854 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SEMA4DQ92854 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SEMA4DQ92854 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SEMA4DQ92854 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SEMA4DQ92854 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SEMA4DQ92854 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SEMA4DQ92854 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SEMA4DQ92854 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SEMA4DQ92854 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SEMA4DQ92854 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SEMA4DQ92854 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SEMA4DQ92854 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SEMA4DQ92854 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SEMA4DQ92854 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SEMA4DQ92854 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SEMA4DQ92854 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SEMA4DQ92854 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SEMA4DQ92854 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SEMA4DQ92854 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SEMA4DQ92854 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SEMA4DQ92854 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SEMA4DQ92854 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SEMA4DQ92854 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SEMA4DQ92854 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SEMA4DQ92854 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SEMA4DQ92854 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SEMA4DQ92854 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SEMA4DQ92854 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SEMA4DQ92854 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SEMA4DQ92854 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SEMA4DQ92854 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms