Protein–RNA interactions for Protein: Q8WU68

U2AF1L4, Splicing factor U2AF 26 kDa subunit, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2AF1L4Q8WU68 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
U2AF1L4Q8WU68 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
U2AF1L4Q8WU68 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
U2AF1L4Q8WU68 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
U2AF1L4Q8WU68 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
U2AF1L4Q8WU68 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
U2AF1L4Q8WU68 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
U2AF1L4Q8WU68 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
U2AF1L4Q8WU68 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
U2AF1L4Q8WU68 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
U2AF1L4Q8WU68 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
U2AF1L4Q8WU68 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
U2AF1L4Q8WU68 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
U2AF1L4Q8WU68 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
U2AF1L4Q8WU68 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
U2AF1L4Q8WU68 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
U2AF1L4Q8WU68 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
U2AF1L4Q8WU68 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
U2AF1L4Q8WU68 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
U2AF1L4Q8WU68 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
U2AF1L4Q8WU68 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
U2AF1L4Q8WU68 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
U2AF1L4Q8WU68 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
U2AF1L4Q8WU68 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
U2AF1L4Q8WU68 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
U2AF1L4Q8WU68 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
U2AF1L4Q8WU68 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
U2AF1L4Q8WU68 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
U2AF1L4Q8WU68 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
U2AF1L4Q8WU68 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
U2AF1L4Q8WU68 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
U2AF1L4Q8WU68 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
U2AF1L4Q8WU68 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
U2AF1L4Q8WU68 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
U2AF1L4Q8WU68 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
U2AF1L4Q8WU68 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
U2AF1L4Q8WU68 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
U2AF1L4Q8WU68 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
U2AF1L4Q8WU68 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
U2AF1L4Q8WU68 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
U2AF1L4Q8WU68 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
U2AF1L4Q8WU68 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
U2AF1L4Q8WU68 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
U2AF1L4Q8WU68 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
U2AF1L4Q8WU68 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
U2AF1L4Q8WU68 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
U2AF1L4Q8WU68 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
U2AF1L4Q8WU68 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
U2AF1L4Q8WU68 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
U2AF1L4Q8WU68 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
U2AF1L4Q8WU68 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
U2AF1L4Q8WU68 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
U2AF1L4Q8WU68 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
U2AF1L4Q8WU68 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
U2AF1L4Q8WU68 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
U2AF1L4Q8WU68 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
U2AF1L4Q8WU68 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
U2AF1L4Q8WU68 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
U2AF1L4Q8WU68 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
U2AF1L4Q8WU68 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
U2AF1L4Q8WU68 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
U2AF1L4Q8WU68 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
U2AF1L4Q8WU68 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
U2AF1L4Q8WU68 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
U2AF1L4Q8WU68 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
U2AF1L4Q8WU68 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
U2AF1L4Q8WU68 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
U2AF1L4Q8WU68 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
U2AF1L4Q8WU68 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
U2AF1L4Q8WU68 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
U2AF1L4Q8WU68 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
U2AF1L4Q8WU68 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
U2AF1L4Q8WU68 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
U2AF1L4Q8WU68 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
U2AF1L4Q8WU68 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
U2AF1L4Q8WU68 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
U2AF1L4Q8WU68 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
U2AF1L4Q8WU68 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
U2AF1L4Q8WU68 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
U2AF1L4Q8WU68 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
U2AF1L4Q8WU68 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
U2AF1L4Q8WU68 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
U2AF1L4Q8WU68 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
U2AF1L4Q8WU68 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
U2AF1L4Q8WU68 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
U2AF1L4Q8WU68 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
U2AF1L4Q8WU68 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
U2AF1L4Q8WU68 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
U2AF1L4Q8WU68 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
U2AF1L4Q8WU68 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
U2AF1L4Q8WU68 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
U2AF1L4Q8WU68 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
U2AF1L4Q8WU68 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
U2AF1L4Q8WU68 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
U2AF1L4Q8WU68 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
U2AF1L4Q8WU68 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
U2AF1L4Q8WU68 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
U2AF1L4Q8WU68 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
U2AF1L4Q8WU68 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
U2AF1L4Q8WU68 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms