Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFW9

MYRIP, Rab effector MyRIP, humanhuman

Predictions only

Length 859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYRIPQ8NFW9 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MYRIPQ8NFW9 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MYRIPQ8NFW9 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MYRIPQ8NFW9 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MYRIPQ8NFW9 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MYRIPQ8NFW9 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MYRIPQ8NFW9 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MYRIPQ8NFW9 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MYRIPQ8NFW9 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MYRIPQ8NFW9 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MYRIPQ8NFW9 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MYRIPQ8NFW9 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MYRIPQ8NFW9 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MYRIPQ8NFW9 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MYRIPQ8NFW9 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MYRIPQ8NFW9 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MYRIPQ8NFW9 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MYRIPQ8NFW9 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MYRIPQ8NFW9 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MYRIPQ8NFW9 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MYRIPQ8NFW9 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MYRIPQ8NFW9 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MYRIPQ8NFW9 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
MYRIPQ8NFW9 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MYRIPQ8NFW9 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MYRIPQ8NFW9 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MYRIPQ8NFW9 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MYRIPQ8NFW9 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MYRIPQ8NFW9 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MYRIPQ8NFW9 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MYRIPQ8NFW9 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MYRIPQ8NFW9 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MYRIPQ8NFW9 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MYRIPQ8NFW9 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MYRIPQ8NFW9 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MYRIPQ8NFW9 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MYRIPQ8NFW9 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MYRIPQ8NFW9 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MYRIPQ8NFW9 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MYRIPQ8NFW9 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MYRIPQ8NFW9 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MYRIPQ8NFW9 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MYRIPQ8NFW9 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MYRIPQ8NFW9 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MYRIPQ8NFW9 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
MYRIPQ8NFW9 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MYRIPQ8NFW9 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MYRIPQ8NFW9 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MYRIPQ8NFW9 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MYRIPQ8NFW9 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MYRIPQ8NFW9 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MYRIPQ8NFW9 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MYRIPQ8NFW9 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MYRIPQ8NFW9 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MYRIPQ8NFW9 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MYRIPQ8NFW9 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MYRIPQ8NFW9 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MYRIPQ8NFW9 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MYRIPQ8NFW9 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MYRIPQ8NFW9 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MYRIPQ8NFW9 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MYRIPQ8NFW9 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MYRIPQ8NFW9 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MYRIPQ8NFW9 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MYRIPQ8NFW9 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MYRIPQ8NFW9 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MYRIPQ8NFW9 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MYRIPQ8NFW9 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MYRIPQ8NFW9 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MYRIPQ8NFW9 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MYRIPQ8NFW9 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MYRIPQ8NFW9 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MYRIPQ8NFW9 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MYRIPQ8NFW9 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MYRIPQ8NFW9 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MYRIPQ8NFW9 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MYRIPQ8NFW9 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MYRIPQ8NFW9 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MYRIPQ8NFW9 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MYRIPQ8NFW9 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MYRIPQ8NFW9 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MYRIPQ8NFW9 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MYRIPQ8NFW9 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MYRIPQ8NFW9 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MYRIPQ8NFW9 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MYRIPQ8NFW9 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MYRIPQ8NFW9 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
MYRIPQ8NFW9 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
MYRIPQ8NFW9 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
MYRIPQ8NFW9 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
MYRIPQ8NFW9 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MYRIPQ8NFW9 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MYRIPQ8NFW9 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MYRIPQ8NFW9 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MYRIPQ8NFW9 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MYRIPQ8NFW9 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
MYRIPQ8NFW9 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
MYRIPQ8NFW9 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MYRIPQ8NFW9 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
MYRIPQ8NFW9 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms