Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFR3

SPTSSB, Serine palmitoyltransferase small subunit B, humanhuman

Predictions only

Length 76 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTSSBQ8NFR3 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SPTSSBQ8NFR3 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
SPTSSBQ8NFR3 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SPTSSBQ8NFR3 ABCA7-201ENST00000263094 6816 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SPTSSBQ8NFR3 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SPTSSBQ8NFR3 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SPTSSBQ8NFR3 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SPTSSBQ8NFR3 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SPTSSBQ8NFR3 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SPTSSBQ8NFR3 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SPTSSBQ8NFR3 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SPTSSBQ8NFR3 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SPTSSBQ8NFR3 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SPTSSBQ8NFR3 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SPTSSBQ8NFR3 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SPTSSBQ8NFR3 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SPTSSBQ8NFR3 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SPTSSBQ8NFR3 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SPTSSBQ8NFR3 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SPTSSBQ8NFR3 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SPTSSBQ8NFR3 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SPTSSBQ8NFR3 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SPTSSBQ8NFR3 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SPTSSBQ8NFR3 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SPTSSBQ8NFR3 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SPTSSBQ8NFR3 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SPTSSBQ8NFR3 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SPTSSBQ8NFR3 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SPTSSBQ8NFR3 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SPTSSBQ8NFR3 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SPTSSBQ8NFR3 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SPTSSBQ8NFR3 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SPTSSBQ8NFR3 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SPTSSBQ8NFR3 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SPTSSBQ8NFR3 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SPTSSBQ8NFR3 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SPTSSBQ8NFR3 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SPTSSBQ8NFR3 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SPTSSBQ8NFR3 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SPTSSBQ8NFR3 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SPTSSBQ8NFR3 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SPTSSBQ8NFR3 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SPTSSBQ8NFR3 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SPTSSBQ8NFR3 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SPTSSBQ8NFR3 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SPTSSBQ8NFR3 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SPTSSBQ8NFR3 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SPTSSBQ8NFR3 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SPTSSBQ8NFR3 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SPTSSBQ8NFR3 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SPTSSBQ8NFR3 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SPTSSBQ8NFR3 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SPTSSBQ8NFR3 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SPTSSBQ8NFR3 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SPTSSBQ8NFR3 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SPTSSBQ8NFR3 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SPTSSBQ8NFR3 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SPTSSBQ8NFR3 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SPTSSBQ8NFR3 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SPTSSBQ8NFR3 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SPTSSBQ8NFR3 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SPTSSBQ8NFR3 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SPTSSBQ8NFR3 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SPTSSBQ8NFR3 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.55
SPTSSBQ8NFR3 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
SPTSSBQ8NFR3 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
SPTSSBQ8NFR3 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
SPTSSBQ8NFR3 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.55
SPTSSBQ8NFR3 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.55
SPTSSBQ8NFR3 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
SPTSSBQ8NFR3 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
SPTSSBQ8NFR3 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
SPTSSBQ8NFR3 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
SPTSSBQ8NFR3 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
SPTSSBQ8NFR3 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
SPTSSBQ8NFR3 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
SPTSSBQ8NFR3 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
SPTSSBQ8NFR3 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
SPTSSBQ8NFR3 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
SPTSSBQ8NFR3 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
SPTSSBQ8NFR3 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
SPTSSBQ8NFR3 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
SPTSSBQ8NFR3 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
SPTSSBQ8NFR3 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
SPTSSBQ8NFR3 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
SPTSSBQ8NFR3 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
SPTSSBQ8NFR3 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
SPTSSBQ8NFR3 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
SPTSSBQ8NFR3 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
SPTSSBQ8NFR3 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
SPTSSBQ8NFR3 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
SPTSSBQ8NFR3 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
SPTSSBQ8NFR3 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
SPTSSBQ8NFR3 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
SPTSSBQ8NFR3 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
SPTSSBQ8NFR3 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
SPTSSBQ8NFR3 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
SPTSSBQ8NFR3 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
SPTSSBQ8NFR3 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
SPTSSBQ8NFR3 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms