Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFH5

NUP35, Nucleoporin NUP53, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP35Q8NFH5 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NUP35Q8NFH5 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NUP35Q8NFH5 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NUP35Q8NFH5 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NUP35Q8NFH5 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NUP35Q8NFH5 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NUP35Q8NFH5 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NUP35Q8NFH5 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NUP35Q8NFH5 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NUP35Q8NFH5 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NUP35Q8NFH5 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NUP35Q8NFH5 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NUP35Q8NFH5 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NUP35Q8NFH5 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NUP35Q8NFH5 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NUP35Q8NFH5 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NUP35Q8NFH5 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NUP35Q8NFH5 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NUP35Q8NFH5 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NUP35Q8NFH5 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NUP35Q8NFH5 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NUP35Q8NFH5 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NUP35Q8NFH5 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NUP35Q8NFH5 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NUP35Q8NFH5 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NUP35Q8NFH5 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NUP35Q8NFH5 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NUP35Q8NFH5 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NUP35Q8NFH5 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NUP35Q8NFH5 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NUP35Q8NFH5 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NUP35Q8NFH5 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NUP35Q8NFH5 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NUP35Q8NFH5 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
NUP35Q8NFH5 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NUP35Q8NFH5 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NUP35Q8NFH5 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NUP35Q8NFH5 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NUP35Q8NFH5 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NUP35Q8NFH5 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NUP35Q8NFH5 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NUP35Q8NFH5 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NUP35Q8NFH5 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NUP35Q8NFH5 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NUP35Q8NFH5 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NUP35Q8NFH5 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NUP35Q8NFH5 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NUP35Q8NFH5 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NUP35Q8NFH5 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NUP35Q8NFH5 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NUP35Q8NFH5 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NUP35Q8NFH5 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NUP35Q8NFH5 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NUP35Q8NFH5 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NUP35Q8NFH5 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NUP35Q8NFH5 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NUP35Q8NFH5 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NUP35Q8NFH5 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NUP35Q8NFH5 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NUP35Q8NFH5 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NUP35Q8NFH5 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NUP35Q8NFH5 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NUP35Q8NFH5 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NUP35Q8NFH5 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NUP35Q8NFH5 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NUP35Q8NFH5 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NUP35Q8NFH5 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NUP35Q8NFH5 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NUP35Q8NFH5 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NUP35Q8NFH5 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NUP35Q8NFH5 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NUP35Q8NFH5 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NUP35Q8NFH5 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NUP35Q8NFH5 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NUP35Q8NFH5 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NUP35Q8NFH5 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NUP35Q8NFH5 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NUP35Q8NFH5 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NUP35Q8NFH5 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NUP35Q8NFH5 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NUP35Q8NFH5 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NUP35Q8NFH5 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NUP35Q8NFH5 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NUP35Q8NFH5 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NUP35Q8NFH5 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
NUP35Q8NFH5 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NUP35Q8NFH5 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NUP35Q8NFH5 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NUP35Q8NFH5 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NUP35Q8NFH5 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NUP35Q8NFH5 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NUP35Q8NFH5 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NUP35Q8NFH5 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NUP35Q8NFH5 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NUP35Q8NFH5 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NUP35Q8NFH5 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NUP35Q8NFH5 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NUP35Q8NFH5 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NUP35Q8NFH5 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NUP35Q8NFH5 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms