Protein–RNA interactions for Protein: Q8NE01

CNNM3, Metal transporter CNNM3, humanhuman

Predictions only

Length 707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNNM3Q8NE01 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CNNM3Q8NE01 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CNNM3Q8NE01 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CNNM3Q8NE01 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CNNM3Q8NE01 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CNNM3Q8NE01 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CNNM3Q8NE01 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CNNM3Q8NE01 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CNNM3Q8NE01 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CNNM3Q8NE01 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CNNM3Q8NE01 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CNNM3Q8NE01 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CNNM3Q8NE01 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CNNM3Q8NE01 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CNNM3Q8NE01 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CNNM3Q8NE01 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CNNM3Q8NE01 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CNNM3Q8NE01 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CNNM3Q8NE01 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CNNM3Q8NE01 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
CNNM3Q8NE01 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CNNM3Q8NE01 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CNNM3Q8NE01 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CNNM3Q8NE01 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CNNM3Q8NE01 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CNNM3Q8NE01 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CNNM3Q8NE01 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CNNM3Q8NE01 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CNNM3Q8NE01 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CNNM3Q8NE01 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CNNM3Q8NE01 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CNNM3Q8NE01 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CNNM3Q8NE01 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CNNM3Q8NE01 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CNNM3Q8NE01 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CNNM3Q8NE01 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CNNM3Q8NE01 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CNNM3Q8NE01 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CNNM3Q8NE01 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CNNM3Q8NE01 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CNNM3Q8NE01 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CNNM3Q8NE01 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CNNM3Q8NE01 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CNNM3Q8NE01 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CNNM3Q8NE01 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CNNM3Q8NE01 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CNNM3Q8NE01 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CNNM3Q8NE01 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CNNM3Q8NE01 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
CNNM3Q8NE01 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
CNNM3Q8NE01 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CNNM3Q8NE01 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CNNM3Q8NE01 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CNNM3Q8NE01 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CNNM3Q8NE01 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CNNM3Q8NE01 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CNNM3Q8NE01 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CNNM3Q8NE01 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CNNM3Q8NE01 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CNNM3Q8NE01 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CNNM3Q8NE01 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CNNM3Q8NE01 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CNNM3Q8NE01 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CNNM3Q8NE01 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CNNM3Q8NE01 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CNNM3Q8NE01 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CNNM3Q8NE01 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CNNM3Q8NE01 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CNNM3Q8NE01 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CNNM3Q8NE01 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CNNM3Q8NE01 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CNNM3Q8NE01 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CNNM3Q8NE01 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CNNM3Q8NE01 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CNNM3Q8NE01 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CNNM3Q8NE01 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CNNM3Q8NE01 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CNNM3Q8NE01 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CNNM3Q8NE01 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CNNM3Q8NE01 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CNNM3Q8NE01 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CNNM3Q8NE01 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CNNM3Q8NE01 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CNNM3Q8NE01 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CNNM3Q8NE01 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CNNM3Q8NE01 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
CNNM3Q8NE01 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CNNM3Q8NE01 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CNNM3Q8NE01 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CNNM3Q8NE01 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CNNM3Q8NE01 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CNNM3Q8NE01 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CNNM3Q8NE01 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CNNM3Q8NE01 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CNNM3Q8NE01 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CNNM3Q8NE01 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CNNM3Q8NE01 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CNNM3Q8NE01 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CNNM3Q8NE01 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CNNM3Q8NE01 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms