Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCU1

CCDC197, Putative uncharacterized protein CCDC197, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC197Q8NCU1 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC197Q8NCU1 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC197Q8NCU1 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC197Q8NCU1 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC197Q8NCU1 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC197Q8NCU1 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC197Q8NCU1 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC197Q8NCU1 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC197Q8NCU1 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC197Q8NCU1 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC197Q8NCU1 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC197Q8NCU1 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC197Q8NCU1 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC197Q8NCU1 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC197Q8NCU1 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC197Q8NCU1 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC197Q8NCU1 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC197Q8NCU1 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC197Q8NCU1 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC197Q8NCU1 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC197Q8NCU1 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC197Q8NCU1 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC197Q8NCU1 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC197Q8NCU1 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC197Q8NCU1 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC197Q8NCU1 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CCDC197Q8NCU1 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CCDC197Q8NCU1 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CCDC197Q8NCU1 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CCDC197Q8NCU1 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CCDC197Q8NCU1 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CCDC197Q8NCU1 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CCDC197Q8NCU1 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CCDC197Q8NCU1 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CCDC197Q8NCU1 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CCDC197Q8NCU1 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CCDC197Q8NCU1 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CCDC197Q8NCU1 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CCDC197Q8NCU1 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CCDC197Q8NCU1 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CCDC197Q8NCU1 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CCDC197Q8NCU1 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC197Q8NCU1 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC197Q8NCU1 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC197Q8NCU1 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC197Q8NCU1 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC197Q8NCU1 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC197Q8NCU1 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC197Q8NCU1 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC197Q8NCU1 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC197Q8NCU1 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC197Q8NCU1 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC197Q8NCU1 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC197Q8NCU1 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC197Q8NCU1 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC197Q8NCU1 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC197Q8NCU1 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC197Q8NCU1 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC197Q8NCU1 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC197Q8NCU1 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC197Q8NCU1 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC197Q8NCU1 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
CCDC197Q8NCU1 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
CCDC197Q8NCU1 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
CCDC197Q8NCU1 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
CCDC197Q8NCU1 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
CCDC197Q8NCU1 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CCDC197Q8NCU1 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CCDC197Q8NCU1 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CCDC197Q8NCU1 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CCDC197Q8NCU1 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CCDC197Q8NCU1 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CCDC197Q8NCU1 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CCDC197Q8NCU1 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CCDC197Q8NCU1 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCDC197Q8NCU1 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCDC197Q8NCU1 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCDC197Q8NCU1 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCDC197Q8NCU1 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCDC197Q8NCU1 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCDC197Q8NCU1 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCDC197Q8NCU1 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCDC197Q8NCU1 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCDC197Q8NCU1 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCDC197Q8NCU1 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCDC197Q8NCU1 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
CCDC197Q8NCU1 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCDC197Q8NCU1 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
CCDC197Q8NCU1 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCDC197Q8NCU1 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCDC197Q8NCU1 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
CCDC197Q8NCU1 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCDC197Q8NCU1 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCDC197Q8NCU1 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCDC197Q8NCU1 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCDC197Q8NCU1 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCDC197Q8NCU1 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCDC197Q8NCU1 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCDC197Q8NCU1 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCDC197Q8NCU1 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms