Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9N7

LRRC57, Leucine-rich repeat-containing protein 57, humanhuman

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC57Q8N9N7 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRRC57Q8N9N7 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRRC57Q8N9N7 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRRC57Q8N9N7 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRRC57Q8N9N7 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRRC57Q8N9N7 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRRC57Q8N9N7 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRRC57Q8N9N7 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
LRRC57Q8N9N7 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRRC57Q8N9N7 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRRC57Q8N9N7 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRRC57Q8N9N7 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRRC57Q8N9N7 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRRC57Q8N9N7 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRRC57Q8N9N7 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRRC57Q8N9N7 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
LRRC57Q8N9N7 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRRC57Q8N9N7 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRRC57Q8N9N7 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRRC57Q8N9N7 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRRC57Q8N9N7 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRRC57Q8N9N7 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRRC57Q8N9N7 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRRC57Q8N9N7 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRRC57Q8N9N7 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRRC57Q8N9N7 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRRC57Q8N9N7 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRRC57Q8N9N7 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRRC57Q8N9N7 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRRC57Q8N9N7 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRRC57Q8N9N7 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRRC57Q8N9N7 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRRC57Q8N9N7 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRRC57Q8N9N7 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRRC57Q8N9N7 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
LRRC57Q8N9N7 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRRC57Q8N9N7 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRRC57Q8N9N7 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRRC57Q8N9N7 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRRC57Q8N9N7 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRRC57Q8N9N7 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRRC57Q8N9N7 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
LRRC57Q8N9N7 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
LRRC57Q8N9N7 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
LRRC57Q8N9N7 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
LRRC57Q8N9N7 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
LRRC57Q8N9N7 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LRRC57Q8N9N7 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
LRRC57Q8N9N7 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LRRC57Q8N9N7 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LRRC57Q8N9N7 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LRRC57Q8N9N7 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LRRC57Q8N9N7 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LRRC57Q8N9N7 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LRRC57Q8N9N7 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LRRC57Q8N9N7 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LRRC57Q8N9N7 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LRRC57Q8N9N7 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRRC57Q8N9N7 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
LRRC57Q8N9N7 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRRC57Q8N9N7 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRRC57Q8N9N7 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRRC57Q8N9N7 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRRC57Q8N9N7 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRRC57Q8N9N7 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRRC57Q8N9N7 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRRC57Q8N9N7 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRRC57Q8N9N7 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRRC57Q8N9N7 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRRC57Q8N9N7 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRRC57Q8N9N7 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRRC57Q8N9N7 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRRC57Q8N9N7 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRRC57Q8N9N7 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRRC57Q8N9N7 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRRC57Q8N9N7 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRRC57Q8N9N7 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRRC57Q8N9N7 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRRC57Q8N9N7 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRRC57Q8N9N7 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRRC57Q8N9N7 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRRC57Q8N9N7 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRRC57Q8N9N7 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRRC57Q8N9N7 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRRC57Q8N9N7 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRRC57Q8N9N7 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRRC57Q8N9N7 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRRC57Q8N9N7 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRRC57Q8N9N7 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRRC57Q8N9N7 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRRC57Q8N9N7 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRRC57Q8N9N7 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRRC57Q8N9N7 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRRC57Q8N9N7 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRRC57Q8N9N7 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRRC57Q8N9N7 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRRC57Q8N9N7 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRRC57Q8N9N7 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRRC57Q8N9N7 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRRC57Q8N9N7 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms