Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXW0

LMNTD2, Lamin tail domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNTD2Q8IXW0 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LMNTD2Q8IXW0 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LMNTD2Q8IXW0 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LMNTD2Q8IXW0 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LMNTD2Q8IXW0 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LMNTD2Q8IXW0 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LMNTD2Q8IXW0 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LMNTD2Q8IXW0 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LMNTD2Q8IXW0 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LMNTD2Q8IXW0 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LMNTD2Q8IXW0 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LMNTD2Q8IXW0 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LMNTD2Q8IXW0 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LMNTD2Q8IXW0 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LMNTD2Q8IXW0 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LMNTD2Q8IXW0 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LMNTD2Q8IXW0 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LMNTD2Q8IXW0 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LMNTD2Q8IXW0 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
LMNTD2Q8IXW0 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LMNTD2Q8IXW0 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LMNTD2Q8IXW0 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LMNTD2Q8IXW0 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LMNTD2Q8IXW0 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LMNTD2Q8IXW0 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LMNTD2Q8IXW0 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LMNTD2Q8IXW0 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LMNTD2Q8IXW0 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LMNTD2Q8IXW0 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LMNTD2Q8IXW0 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LMNTD2Q8IXW0 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LMNTD2Q8IXW0 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LMNTD2Q8IXW0 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LMNTD2Q8IXW0 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LMNTD2Q8IXW0 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LMNTD2Q8IXW0 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LMNTD2Q8IXW0 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LMNTD2Q8IXW0 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LMNTD2Q8IXW0 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LMNTD2Q8IXW0 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LMNTD2Q8IXW0 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LMNTD2Q8IXW0 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LMNTD2Q8IXW0 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LMNTD2Q8IXW0 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LMNTD2Q8IXW0 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LMNTD2Q8IXW0 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LMNTD2Q8IXW0 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LMNTD2Q8IXW0 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
LMNTD2Q8IXW0 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LMNTD2Q8IXW0 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LMNTD2Q8IXW0 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LMNTD2Q8IXW0 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LMNTD2Q8IXW0 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LMNTD2Q8IXW0 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LMNTD2Q8IXW0 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LMNTD2Q8IXW0 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LMNTD2Q8IXW0 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LMNTD2Q8IXW0 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LMNTD2Q8IXW0 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LMNTD2Q8IXW0 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LMNTD2Q8IXW0 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LMNTD2Q8IXW0 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LMNTD2Q8IXW0 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LMNTD2Q8IXW0 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LMNTD2Q8IXW0 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LMNTD2Q8IXW0 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LMNTD2Q8IXW0 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LMNTD2Q8IXW0 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LMNTD2Q8IXW0 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LMNTD2Q8IXW0 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LMNTD2Q8IXW0 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
LMNTD2Q8IXW0 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LMNTD2Q8IXW0 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LMNTD2Q8IXW0 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LMNTD2Q8IXW0 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
LMNTD2Q8IXW0 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LMNTD2Q8IXW0 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
LMNTD2Q8IXW0 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
LMNTD2Q8IXW0 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LMNTD2Q8IXW0 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LMNTD2Q8IXW0 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
LMNTD2Q8IXW0 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
LMNTD2Q8IXW0 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
LMNTD2Q8IXW0 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
LMNTD2Q8IXW0 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
LMNTD2Q8IXW0 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
LMNTD2Q8IXW0 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
LMNTD2Q8IXW0 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LMNTD2Q8IXW0 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
LMNTD2Q8IXW0 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LMNTD2Q8IXW0 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
LMNTD2Q8IXW0 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
LMNTD2Q8IXW0 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LMNTD2Q8IXW0 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LMNTD2Q8IXW0 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
LMNTD2Q8IXW0 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC21.32■■□□□ 1
LMNTD2Q8IXW0 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
LMNTD2Q8IXW0 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LMNTD2Q8IXW0 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
LMNTD2Q8IXW0 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms