Protein–RNA interactions for Protein: Q8IV31

TMEM139, Transmembrane protein 139, humanhuman

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM139Q8IV31 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMEM139Q8IV31 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMEM139Q8IV31 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
TMEM139Q8IV31 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMEM139Q8IV31 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMEM139Q8IV31 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMEM139Q8IV31 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMEM139Q8IV31 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMEM139Q8IV31 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMEM139Q8IV31 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMEM139Q8IV31 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMEM139Q8IV31 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMEM139Q8IV31 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMEM139Q8IV31 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMEM139Q8IV31 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMEM139Q8IV31 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMEM139Q8IV31 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMEM139Q8IV31 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMEM139Q8IV31 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMEM139Q8IV31 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMEM139Q8IV31 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
TMEM139Q8IV31 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMEM139Q8IV31 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMEM139Q8IV31 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMEM139Q8IV31 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMEM139Q8IV31 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMEM139Q8IV31 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMEM139Q8IV31 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMEM139Q8IV31 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMEM139Q8IV31 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMEM139Q8IV31 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMEM139Q8IV31 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMEM139Q8IV31 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMEM139Q8IV31 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMEM139Q8IV31 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMEM139Q8IV31 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMEM139Q8IV31 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMEM139Q8IV31 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMEM139Q8IV31 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMEM139Q8IV31 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMEM139Q8IV31 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMEM139Q8IV31 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMEM139Q8IV31 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMEM139Q8IV31 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
TMEM139Q8IV31 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMEM139Q8IV31 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMEM139Q8IV31 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMEM139Q8IV31 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMEM139Q8IV31 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMEM139Q8IV31 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMEM139Q8IV31 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMEM139Q8IV31 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMEM139Q8IV31 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMEM139Q8IV31 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMEM139Q8IV31 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMEM139Q8IV31 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMEM139Q8IV31 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMEM139Q8IV31 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
TMEM139Q8IV31 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC22.7■■□□□ 1.23
TMEM139Q8IV31 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
TMEM139Q8IV31 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
TMEM139Q8IV31 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMEM139Q8IV31 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMEM139Q8IV31 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMEM139Q8IV31 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMEM139Q8IV31 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMEM139Q8IV31 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMEM139Q8IV31 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMEM139Q8IV31 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMEM139Q8IV31 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMEM139Q8IV31 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMEM139Q8IV31 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMEM139Q8IV31 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMEM139Q8IV31 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMEM139Q8IV31 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMEM139Q8IV31 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMEM139Q8IV31 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
TMEM139Q8IV31 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMEM139Q8IV31 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMEM139Q8IV31 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMEM139Q8IV31 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMEM139Q8IV31 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMEM139Q8IV31 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMEM139Q8IV31 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMEM139Q8IV31 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMEM139Q8IV31 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMEM139Q8IV31 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMEM139Q8IV31 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMEM139Q8IV31 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMEM139Q8IV31 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMEM139Q8IV31 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMEM139Q8IV31 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMEM139Q8IV31 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMEM139Q8IV31 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMEM139Q8IV31 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
TMEM139Q8IV31 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMEM139Q8IV31 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMEM139Q8IV31 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMEM139Q8IV31 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMEM139Q8IV31 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.6 ms