Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z2E3

APTX, Aprataxin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APTXQ7Z2E3 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
APTXQ7Z2E3 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
APTXQ7Z2E3 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
APTXQ7Z2E3 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
APTXQ7Z2E3 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
APTXQ7Z2E3 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
APTXQ7Z2E3 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
APTXQ7Z2E3 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
APTXQ7Z2E3 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
APTXQ7Z2E3 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
APTXQ7Z2E3 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
APTXQ7Z2E3 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
APTXQ7Z2E3 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
APTXQ7Z2E3 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
APTXQ7Z2E3 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
APTXQ7Z2E3 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
APTXQ7Z2E3 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
APTXQ7Z2E3 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
APTXQ7Z2E3 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
APTXQ7Z2E3 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
APTXQ7Z2E3 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
APTXQ7Z2E3 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
APTXQ7Z2E3 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
APTXQ7Z2E3 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
APTXQ7Z2E3 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
APTXQ7Z2E3 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
APTXQ7Z2E3 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
APTXQ7Z2E3 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
APTXQ7Z2E3 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
APTXQ7Z2E3 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
APTXQ7Z2E3 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
APTXQ7Z2E3 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
APTXQ7Z2E3 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
APTXQ7Z2E3 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
APTXQ7Z2E3 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
APTXQ7Z2E3 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
APTXQ7Z2E3 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
APTXQ7Z2E3 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
APTXQ7Z2E3 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
APTXQ7Z2E3 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
APTXQ7Z2E3 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
APTXQ7Z2E3 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
APTXQ7Z2E3 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
APTXQ7Z2E3 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
APTXQ7Z2E3 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
APTXQ7Z2E3 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
APTXQ7Z2E3 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
APTXQ7Z2E3 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
APTXQ7Z2E3 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
APTXQ7Z2E3 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
APTXQ7Z2E3 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
APTXQ7Z2E3 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
APTXQ7Z2E3 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
APTXQ7Z2E3 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
APTXQ7Z2E3 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
APTXQ7Z2E3 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
APTXQ7Z2E3 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
APTXQ7Z2E3 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
APTXQ7Z2E3 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
APTXQ7Z2E3 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
APTXQ7Z2E3 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
APTXQ7Z2E3 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
APTXQ7Z2E3 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
APTXQ7Z2E3 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
APTXQ7Z2E3 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
APTXQ7Z2E3 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
APTXQ7Z2E3 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
APTXQ7Z2E3 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
APTXQ7Z2E3 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
APTXQ7Z2E3 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
APTXQ7Z2E3 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
APTXQ7Z2E3 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
APTXQ7Z2E3 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
APTXQ7Z2E3 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
APTXQ7Z2E3 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
APTXQ7Z2E3 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
APTXQ7Z2E3 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
APTXQ7Z2E3 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
APTXQ7Z2E3 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
APTXQ7Z2E3 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
APTXQ7Z2E3 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
APTXQ7Z2E3 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
APTXQ7Z2E3 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
APTXQ7Z2E3 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
APTXQ7Z2E3 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
APTXQ7Z2E3 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
APTXQ7Z2E3 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
APTXQ7Z2E3 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
APTXQ7Z2E3 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
APTXQ7Z2E3 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
APTXQ7Z2E3 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
APTXQ7Z2E3 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
APTXQ7Z2E3 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
APTXQ7Z2E3 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
APTXQ7Z2E3 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
APTXQ7Z2E3 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
APTXQ7Z2E3 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
APTXQ7Z2E3 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
APTXQ7Z2E3 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
APTXQ7Z2E3 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms