Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU9

STRC, Stereocilin, humanhuman

Predictions only

Length 1,775 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRCQ7RTU9 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
STRCQ7RTU9 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
STRCQ7RTU9 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
STRCQ7RTU9 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
STRCQ7RTU9 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
STRCQ7RTU9 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC30.41■■■□□ 2.46
STRCQ7RTU9 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC30.41■■■□□ 2.46
STRCQ7RTU9 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
STRCQ7RTU9 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
STRCQ7RTU9 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC30.41■■■□□ 2.46
STRCQ7RTU9 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC30.41■■■□□ 2.46
STRCQ7RTU9 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
STRCQ7RTU9 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
STRCQ7RTU9 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
STRCQ7RTU9 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
STRCQ7RTU9 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
STRCQ7RTU9 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
STRCQ7RTU9 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
STRCQ7RTU9 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
STRCQ7RTU9 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
STRCQ7RTU9 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
STRCQ7RTU9 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
STRCQ7RTU9 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.46
STRCQ7RTU9 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
STRCQ7RTU9 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC30.38■■■□□ 2.45
STRCQ7RTU9 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
STRCQ7RTU9 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
STRCQ7RTU9 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
STRCQ7RTU9 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
STRCQ7RTU9 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
STRCQ7RTU9 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC30.38■■■□□ 2.45
STRCQ7RTU9 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
STRCQ7RTU9 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC30.38■■■□□ 2.45
STRCQ7RTU9 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
STRCQ7RTU9 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
STRCQ7RTU9 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC30.37■■■□□ 2.45
STRCQ7RTU9 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC30.37■■■□□ 2.45
STRCQ7RTU9 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
STRCQ7RTU9 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
STRCQ7RTU9 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
STRCQ7RTU9 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
STRCQ7RTU9 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
STRCQ7RTU9 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
STRCQ7RTU9 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
STRCQ7RTU9 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
STRCQ7RTU9 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
STRCQ7RTU9 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
STRCQ7RTU9 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
STRCQ7RTU9 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
STRCQ7RTU9 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
STRCQ7RTU9 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
STRCQ7RTU9 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
STRCQ7RTU9 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
STRCQ7RTU9 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
STRCQ7RTU9 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
STRCQ7RTU9 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
STRCQ7RTU9 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC30.34■■■□□ 2.45
STRCQ7RTU9 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
STRCQ7RTU9 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
STRCQ7RTU9 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC30.34■■■□□ 2.45
STRCQ7RTU9 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.34■■■□□ 2.45
STRCQ7RTU9 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
STRCQ7RTU9 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
STRCQ7RTU9 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC30.33■■■□□ 2.45
STRCQ7RTU9 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
STRCQ7RTU9 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
STRCQ7RTU9 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
STRCQ7RTU9 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC30.33■■■□□ 2.45
STRCQ7RTU9 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
STRCQ7RTU9 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
STRCQ7RTU9 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
STRCQ7RTU9 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
STRCQ7RTU9 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
STRCQ7RTU9 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
STRCQ7RTU9 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC30.33■■■□□ 2.45
STRCQ7RTU9 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
STRCQ7RTU9 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC30.33■■■□□ 2.45
STRCQ7RTU9 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
STRCQ7RTU9 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
STRCQ7RTU9 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC30.32■■■□□ 2.44
STRCQ7RTU9 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.44
STRCQ7RTU9 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC30.32■■■□□ 2.44
STRCQ7RTU9 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
STRCQ7RTU9 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.44
STRCQ7RTU9 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
STRCQ7RTU9 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
STRCQ7RTU9 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC30.31■■■□□ 2.44
STRCQ7RTU9 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
STRCQ7RTU9 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.31■■■□□ 2.44
STRCQ7RTU9 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC30.31■■■□□ 2.44
STRCQ7RTU9 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
STRCQ7RTU9 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.31■■■□□ 2.44
STRCQ7RTU9 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
STRCQ7RTU9 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC30.31■■■□□ 2.44
STRCQ7RTU9 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
STRCQ7RTU9 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
STRCQ7RTU9 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
STRCQ7RTU9 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
STRCQ7RTU9 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC30.31■■■□□ 2.44
STRCQ7RTU9 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms