Protein–RNA interactions for Protein: Q71UI9

H2AFV, Histone H2A.V, humanhuman

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2AFVQ71UI9 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
H2AFVQ71UI9 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
H2AFVQ71UI9 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
H2AFVQ71UI9 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
H2AFVQ71UI9 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
H2AFVQ71UI9 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
H2AFVQ71UI9 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
H2AFVQ71UI9 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
H2AFVQ71UI9 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
H2AFVQ71UI9 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
H2AFVQ71UI9 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
H2AFVQ71UI9 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
H2AFVQ71UI9 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
H2AFVQ71UI9 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
H2AFVQ71UI9 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
H2AFVQ71UI9 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
H2AFVQ71UI9 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
H2AFVQ71UI9 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
H2AFVQ71UI9 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
H2AFVQ71UI9 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
H2AFVQ71UI9 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
H2AFVQ71UI9 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
H2AFVQ71UI9 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
H2AFVQ71UI9 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
H2AFVQ71UI9 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
H2AFVQ71UI9 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
H2AFVQ71UI9 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
H2AFVQ71UI9 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
H2AFVQ71UI9 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
H2AFVQ71UI9 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
H2AFVQ71UI9 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
H2AFVQ71UI9 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
H2AFVQ71UI9 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
H2AFVQ71UI9 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
H2AFVQ71UI9 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
H2AFVQ71UI9 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
H2AFVQ71UI9 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
H2AFVQ71UI9 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
H2AFVQ71UI9 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
H2AFVQ71UI9 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
H2AFVQ71UI9 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
H2AFVQ71UI9 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
H2AFVQ71UI9 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
H2AFVQ71UI9 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
H2AFVQ71UI9 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
H2AFVQ71UI9 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
H2AFVQ71UI9 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
H2AFVQ71UI9 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
H2AFVQ71UI9 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
H2AFVQ71UI9 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
H2AFVQ71UI9 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
H2AFVQ71UI9 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
H2AFVQ71UI9 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
H2AFVQ71UI9 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
H2AFVQ71UI9 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
H2AFVQ71UI9 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
H2AFVQ71UI9 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
H2AFVQ71UI9 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
H2AFVQ71UI9 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
H2AFVQ71UI9 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
H2AFVQ71UI9 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
H2AFVQ71UI9 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
H2AFVQ71UI9 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
H2AFVQ71UI9 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
H2AFVQ71UI9 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
H2AFVQ71UI9 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
H2AFVQ71UI9 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
H2AFVQ71UI9 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
H2AFVQ71UI9 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
H2AFVQ71UI9 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
H2AFVQ71UI9 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
H2AFVQ71UI9 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
H2AFVQ71UI9 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
H2AFVQ71UI9 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
H2AFVQ71UI9 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
H2AFVQ71UI9 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
H2AFVQ71UI9 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
H2AFVQ71UI9 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
H2AFVQ71UI9 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
H2AFVQ71UI9 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
H2AFVQ71UI9 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
H2AFVQ71UI9 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
H2AFVQ71UI9 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
H2AFVQ71UI9 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
H2AFVQ71UI9 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
H2AFVQ71UI9 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
H2AFVQ71UI9 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
H2AFVQ71UI9 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
H2AFVQ71UI9 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
H2AFVQ71UI9 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
H2AFVQ71UI9 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
H2AFVQ71UI9 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
H2AFVQ71UI9 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
H2AFVQ71UI9 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
H2AFVQ71UI9 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
H2AFVQ71UI9 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
H2AFVQ71UI9 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
H2AFVQ71UI9 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
H2AFVQ71UI9 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
H2AFVQ71UI9 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms