Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRR5

TMEM136, Transmembrane protein 136, humanhuman

Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM136Q6ZRR5 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMEM136Q6ZRR5 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMEM136Q6ZRR5 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMEM136Q6ZRR5 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMEM136Q6ZRR5 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMEM136Q6ZRR5 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMEM136Q6ZRR5 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMEM136Q6ZRR5 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
TMEM136Q6ZRR5 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
TMEM136Q6ZRR5 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMEM136Q6ZRR5 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMEM136Q6ZRR5 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMEM136Q6ZRR5 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMEM136Q6ZRR5 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMEM136Q6ZRR5 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMEM136Q6ZRR5 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMEM136Q6ZRR5 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMEM136Q6ZRR5 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMEM136Q6ZRR5 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMEM136Q6ZRR5 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMEM136Q6ZRR5 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMEM136Q6ZRR5 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMEM136Q6ZRR5 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMEM136Q6ZRR5 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMEM136Q6ZRR5 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMEM136Q6ZRR5 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMEM136Q6ZRR5 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMEM136Q6ZRR5 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMEM136Q6ZRR5 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMEM136Q6ZRR5 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMEM136Q6ZRR5 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMEM136Q6ZRR5 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMEM136Q6ZRR5 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMEM136Q6ZRR5 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMEM136Q6ZRR5 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMEM136Q6ZRR5 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMEM136Q6ZRR5 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMEM136Q6ZRR5 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMEM136Q6ZRR5 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMEM136Q6ZRR5 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMEM136Q6ZRR5 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMEM136Q6ZRR5 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMEM136Q6ZRR5 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMEM136Q6ZRR5 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMEM136Q6ZRR5 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMEM136Q6ZRR5 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
TMEM136Q6ZRR5 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMEM136Q6ZRR5 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMEM136Q6ZRR5 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMEM136Q6ZRR5 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMEM136Q6ZRR5 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TMEM136Q6ZRR5 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
TMEM136Q6ZRR5 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TMEM136Q6ZRR5 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TMEM136Q6ZRR5 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TMEM136Q6ZRR5 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TMEM136Q6ZRR5 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM136Q6ZRR5 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM136Q6ZRR5 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM136Q6ZRR5 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM136Q6ZRR5 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM136Q6ZRR5 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM136Q6ZRR5 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM136Q6ZRR5 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM136Q6ZRR5 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM136Q6ZRR5 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM136Q6ZRR5 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM136Q6ZRR5 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM136Q6ZRR5 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM136Q6ZRR5 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM136Q6ZRR5 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM136Q6ZRR5 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM136Q6ZRR5 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM136Q6ZRR5 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM136Q6ZRR5 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM136Q6ZRR5 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM136Q6ZRR5 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM136Q6ZRR5 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM136Q6ZRR5 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM136Q6ZRR5 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM136Q6ZRR5 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM136Q6ZRR5 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM136Q6ZRR5 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM136Q6ZRR5 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM136Q6ZRR5 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM136Q6ZRR5 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM136Q6ZRR5 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM136Q6ZRR5 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM136Q6ZRR5 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM136Q6ZRR5 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM136Q6ZRR5 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM136Q6ZRR5 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM136Q6ZRR5 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM136Q6ZRR5 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM136Q6ZRR5 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM136Q6ZRR5 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM136Q6ZRR5 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM136Q6ZRR5 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM136Q6ZRR5 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM136Q6ZRR5 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms