Protein–RNA interactions for Protein: Q6PIF2

SYCE2, Synaptonemal complex central element protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCE2Q6PIF2 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SYCE2Q6PIF2 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SYCE2Q6PIF2 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SYCE2Q6PIF2 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SYCE2Q6PIF2 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SYCE2Q6PIF2 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SYCE2Q6PIF2 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SYCE2Q6PIF2 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SYCE2Q6PIF2 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SYCE2Q6PIF2 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SYCE2Q6PIF2 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SYCE2Q6PIF2 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SYCE2Q6PIF2 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SYCE2Q6PIF2 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SYCE2Q6PIF2 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SYCE2Q6PIF2 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SYCE2Q6PIF2 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SYCE2Q6PIF2 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SYCE2Q6PIF2 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SYCE2Q6PIF2 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SYCE2Q6PIF2 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SYCE2Q6PIF2 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SYCE2Q6PIF2 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SYCE2Q6PIF2 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SYCE2Q6PIF2 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SYCE2Q6PIF2 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SYCE2Q6PIF2 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SYCE2Q6PIF2 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SYCE2Q6PIF2 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SYCE2Q6PIF2 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SYCE2Q6PIF2 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SYCE2Q6PIF2 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SYCE2Q6PIF2 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SYCE2Q6PIF2 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SYCE2Q6PIF2 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SYCE2Q6PIF2 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SYCE2Q6PIF2 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SYCE2Q6PIF2 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SYCE2Q6PIF2 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SYCE2Q6PIF2 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SYCE2Q6PIF2 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SYCE2Q6PIF2 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SYCE2Q6PIF2 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SYCE2Q6PIF2 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SYCE2Q6PIF2 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SYCE2Q6PIF2 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SYCE2Q6PIF2 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SYCE2Q6PIF2 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SYCE2Q6PIF2 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SYCE2Q6PIF2 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SYCE2Q6PIF2 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SYCE2Q6PIF2 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SYCE2Q6PIF2 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SYCE2Q6PIF2 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SYCE2Q6PIF2 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SYCE2Q6PIF2 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SYCE2Q6PIF2 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SYCE2Q6PIF2 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SYCE2Q6PIF2 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SYCE2Q6PIF2 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SYCE2Q6PIF2 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SYCE2Q6PIF2 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SYCE2Q6PIF2 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SYCE2Q6PIF2 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SYCE2Q6PIF2 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SYCE2Q6PIF2 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SYCE2Q6PIF2 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SYCE2Q6PIF2 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SYCE2Q6PIF2 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SYCE2Q6PIF2 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SYCE2Q6PIF2 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SYCE2Q6PIF2 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SYCE2Q6PIF2 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SYCE2Q6PIF2 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SYCE2Q6PIF2 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SYCE2Q6PIF2 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SYCE2Q6PIF2 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SYCE2Q6PIF2 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SYCE2Q6PIF2 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SYCE2Q6PIF2 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SYCE2Q6PIF2 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SYCE2Q6PIF2 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SYCE2Q6PIF2 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SYCE2Q6PIF2 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SYCE2Q6PIF2 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SYCE2Q6PIF2 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SYCE2Q6PIF2 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SYCE2Q6PIF2 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SYCE2Q6PIF2 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SYCE2Q6PIF2 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SYCE2Q6PIF2 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SYCE2Q6PIF2 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SYCE2Q6PIF2 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SYCE2Q6PIF2 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SYCE2Q6PIF2 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SYCE2Q6PIF2 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SYCE2Q6PIF2 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SYCE2Q6PIF2 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SYCE2Q6PIF2 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SYCE2Q6PIF2 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms