Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5Q4

LMOD2, Leiomodin-2, humanhuman

Predictions only

Length 547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMOD2Q6P5Q4 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
LMOD2Q6P5Q4 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
LMOD2Q6P5Q4 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
LMOD2Q6P5Q4 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
LMOD2Q6P5Q4 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
LMOD2Q6P5Q4 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
LMOD2Q6P5Q4 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
LMOD2Q6P5Q4 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
LMOD2Q6P5Q4 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
LMOD2Q6P5Q4 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
LMOD2Q6P5Q4 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
LMOD2Q6P5Q4 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
LMOD2Q6P5Q4 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
LMOD2Q6P5Q4 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
LMOD2Q6P5Q4 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
LMOD2Q6P5Q4 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
LMOD2Q6P5Q4 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
LMOD2Q6P5Q4 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
LMOD2Q6P5Q4 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
LMOD2Q6P5Q4 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
LMOD2Q6P5Q4 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
LMOD2Q6P5Q4 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
LMOD2Q6P5Q4 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
LMOD2Q6P5Q4 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
LMOD2Q6P5Q4 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
LMOD2Q6P5Q4 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
LMOD2Q6P5Q4 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
LMOD2Q6P5Q4 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
LMOD2Q6P5Q4 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
LMOD2Q6P5Q4 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
LMOD2Q6P5Q4 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
LMOD2Q6P5Q4 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
LMOD2Q6P5Q4 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
LMOD2Q6P5Q4 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
LMOD2Q6P5Q4 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
LMOD2Q6P5Q4 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
LMOD2Q6P5Q4 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
LMOD2Q6P5Q4 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC28.76■■■□□ 2.19
LMOD2Q6P5Q4 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
LMOD2Q6P5Q4 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
LMOD2Q6P5Q4 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
LMOD2Q6P5Q4 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
LMOD2Q6P5Q4 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
LMOD2Q6P5Q4 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
LMOD2Q6P5Q4 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
LMOD2Q6P5Q4 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
LMOD2Q6P5Q4 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
LMOD2Q6P5Q4 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
LMOD2Q6P5Q4 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
LMOD2Q6P5Q4 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
LMOD2Q6P5Q4 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
LMOD2Q6P5Q4 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
LMOD2Q6P5Q4 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
LMOD2Q6P5Q4 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
LMOD2Q6P5Q4 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
LMOD2Q6P5Q4 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
LMOD2Q6P5Q4 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
LMOD2Q6P5Q4 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
LMOD2Q6P5Q4 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
LMOD2Q6P5Q4 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
LMOD2Q6P5Q4 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC28.74■■■□□ 2.19
LMOD2Q6P5Q4 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
LMOD2Q6P5Q4 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
LMOD2Q6P5Q4 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
LMOD2Q6P5Q4 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
LMOD2Q6P5Q4 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
LMOD2Q6P5Q4 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
LMOD2Q6P5Q4 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
LMOD2Q6P5Q4 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
LMOD2Q6P5Q4 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
LMOD2Q6P5Q4 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
LMOD2Q6P5Q4 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
LMOD2Q6P5Q4 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
LMOD2Q6P5Q4 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
LMOD2Q6P5Q4 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC28.73■■■□□ 2.19
LMOD2Q6P5Q4 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
LMOD2Q6P5Q4 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
LMOD2Q6P5Q4 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
LMOD2Q6P5Q4 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
LMOD2Q6P5Q4 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
LMOD2Q6P5Q4 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
LMOD2Q6P5Q4 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
LMOD2Q6P5Q4 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
LMOD2Q6P5Q4 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC28.72■■■□□ 2.19
LMOD2Q6P5Q4 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
LMOD2Q6P5Q4 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
LMOD2Q6P5Q4 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
LMOD2Q6P5Q4 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
LMOD2Q6P5Q4 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
LMOD2Q6P5Q4 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
LMOD2Q6P5Q4 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
LMOD2Q6P5Q4 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
LMOD2Q6P5Q4 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
LMOD2Q6P5Q4 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
LMOD2Q6P5Q4 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
LMOD2Q6P5Q4 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
LMOD2Q6P5Q4 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
LMOD2Q6P5Q4 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
LMOD2Q6P5Q4 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
LMOD2Q6P5Q4 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms