Protein–RNA interactions for Protein: Q6IPU0

CENPP, Centromere protein P, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPPQ6IPU0 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CENPPQ6IPU0 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CENPPQ6IPU0 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CENPPQ6IPU0 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CENPPQ6IPU0 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CENPPQ6IPU0 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CENPPQ6IPU0 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CENPPQ6IPU0 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CENPPQ6IPU0 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CENPPQ6IPU0 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CENPPQ6IPU0 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CENPPQ6IPU0 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CENPPQ6IPU0 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CENPPQ6IPU0 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CENPPQ6IPU0 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CENPPQ6IPU0 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CENPPQ6IPU0 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CENPPQ6IPU0 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CENPPQ6IPU0 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CENPPQ6IPU0 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CENPPQ6IPU0 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CENPPQ6IPU0 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CENPPQ6IPU0 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CENPPQ6IPU0 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CENPPQ6IPU0 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CENPPQ6IPU0 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CENPPQ6IPU0 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CENPPQ6IPU0 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CENPPQ6IPU0 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CENPPQ6IPU0 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CENPPQ6IPU0 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CENPPQ6IPU0 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CENPPQ6IPU0 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CENPPQ6IPU0 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CENPPQ6IPU0 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CENPPQ6IPU0 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CENPPQ6IPU0 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CENPPQ6IPU0 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CENPPQ6IPU0 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CENPPQ6IPU0 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CENPPQ6IPU0 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CENPPQ6IPU0 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CENPPQ6IPU0 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CENPPQ6IPU0 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CENPPQ6IPU0 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CENPPQ6IPU0 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CENPPQ6IPU0 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CENPPQ6IPU0 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CENPPQ6IPU0 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CENPPQ6IPU0 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CENPPQ6IPU0 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CENPPQ6IPU0 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CENPPQ6IPU0 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CENPPQ6IPU0 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CENPPQ6IPU0 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CENPPQ6IPU0 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CENPPQ6IPU0 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CENPPQ6IPU0 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CENPPQ6IPU0 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CENPPQ6IPU0 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CENPPQ6IPU0 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CENPPQ6IPU0 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CENPPQ6IPU0 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CENPPQ6IPU0 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CENPPQ6IPU0 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CENPPQ6IPU0 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CENPPQ6IPU0 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CENPPQ6IPU0 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CENPPQ6IPU0 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CENPPQ6IPU0 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CENPPQ6IPU0 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CENPPQ6IPU0 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CENPPQ6IPU0 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CENPPQ6IPU0 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CENPPQ6IPU0 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CENPPQ6IPU0 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CENPPQ6IPU0 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CENPPQ6IPU0 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CENPPQ6IPU0 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CENPPQ6IPU0 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CENPPQ6IPU0 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CENPPQ6IPU0 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CENPPQ6IPU0 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CENPPQ6IPU0 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CENPPQ6IPU0 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CENPPQ6IPU0 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CENPPQ6IPU0 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CENPPQ6IPU0 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CENPPQ6IPU0 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CENPPQ6IPU0 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CENPPQ6IPU0 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CENPPQ6IPU0 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CENPPQ6IPU0 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CENPPQ6IPU0 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CENPPQ6IPU0 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CENPPQ6IPU0 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CENPPQ6IPU0 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CENPPQ6IPU0 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CENPPQ6IPU0 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CENPPQ6IPU0 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms