Protein–RNA interactions for Protein: Q6ICL7

SLC35E4, Solute carrier family 35 member E4, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC35E4Q6ICL7 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SLC35E4Q6ICL7 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SLC35E4Q6ICL7 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SLC35E4Q6ICL7 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SLC35E4Q6ICL7 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SLC35E4Q6ICL7 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SLC35E4Q6ICL7 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SLC35E4Q6ICL7 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SLC35E4Q6ICL7 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SLC35E4Q6ICL7 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SLC35E4Q6ICL7 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SLC35E4Q6ICL7 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SLC35E4Q6ICL7 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SLC35E4Q6ICL7 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SLC35E4Q6ICL7 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SLC35E4Q6ICL7 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SLC35E4Q6ICL7 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SLC35E4Q6ICL7 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SLC35E4Q6ICL7 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SLC35E4Q6ICL7 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SLC35E4Q6ICL7 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SLC35E4Q6ICL7 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SLC35E4Q6ICL7 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SLC35E4Q6ICL7 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SLC35E4Q6ICL7 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SLC35E4Q6ICL7 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SLC35E4Q6ICL7 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SLC35E4Q6ICL7 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SLC35E4Q6ICL7 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SLC35E4Q6ICL7 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SLC35E4Q6ICL7 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
SLC35E4Q6ICL7 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SLC35E4Q6ICL7 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SLC35E4Q6ICL7 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SLC35E4Q6ICL7 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SLC35E4Q6ICL7 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SLC35E4Q6ICL7 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SLC35E4Q6ICL7 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SLC35E4Q6ICL7 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SLC35E4Q6ICL7 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SLC35E4Q6ICL7 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SLC35E4Q6ICL7 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SLC35E4Q6ICL7 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SLC35E4Q6ICL7 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SLC35E4Q6ICL7 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SLC35E4Q6ICL7 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SLC35E4Q6ICL7 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SLC35E4Q6ICL7 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
SLC35E4Q6ICL7 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SLC35E4Q6ICL7 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SLC35E4Q6ICL7 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SLC35E4Q6ICL7 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SLC35E4Q6ICL7 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SLC35E4Q6ICL7 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SLC35E4Q6ICL7 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SLC35E4Q6ICL7 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
SLC35E4Q6ICL7 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SLC35E4Q6ICL7 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SLC35E4Q6ICL7 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SLC35E4Q6ICL7 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SLC35E4Q6ICL7 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SLC35E4Q6ICL7 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SLC35E4Q6ICL7 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SLC35E4Q6ICL7 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SLC35E4Q6ICL7 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SLC35E4Q6ICL7 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SLC35E4Q6ICL7 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SLC35E4Q6ICL7 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SLC35E4Q6ICL7 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SLC35E4Q6ICL7 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SLC35E4Q6ICL7 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
SLC35E4Q6ICL7 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SLC35E4Q6ICL7 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SLC35E4Q6ICL7 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SLC35E4Q6ICL7 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SLC35E4Q6ICL7 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SLC35E4Q6ICL7 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SLC35E4Q6ICL7 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SLC35E4Q6ICL7 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SLC35E4Q6ICL7 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SLC35E4Q6ICL7 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SLC35E4Q6ICL7 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SLC35E4Q6ICL7 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SLC35E4Q6ICL7 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SLC35E4Q6ICL7 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SLC35E4Q6ICL7 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SLC35E4Q6ICL7 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SLC35E4Q6ICL7 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SLC35E4Q6ICL7 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SLC35E4Q6ICL7 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SLC35E4Q6ICL7 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SLC35E4Q6ICL7 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SLC35E4Q6ICL7 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SLC35E4Q6ICL7 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SLC35E4Q6ICL7 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SLC35E4Q6ICL7 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLC35E4Q6ICL7 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLC35E4Q6ICL7 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLC35E4Q6ICL7 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLC35E4Q6ICL7 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms