Protein–RNA interactions for Protein: Q6DN14

MCTP1, Multiple C2 and transmembrane domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 999 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCTP1Q6DN14 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
MCTP1Q6DN14 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
MCTP1Q6DN14 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
MCTP1Q6DN14 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
MCTP1Q6DN14 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
MCTP1Q6DN14 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MCTP1Q6DN14 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MCTP1Q6DN14 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MCTP1Q6DN14 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MCTP1Q6DN14 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MCTP1Q6DN14 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
MCTP1Q6DN14 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
MCTP1Q6DN14 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
MCTP1Q6DN14 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MCTP1Q6DN14 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
MCTP1Q6DN14 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MCTP1Q6DN14 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
MCTP1Q6DN14 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
MCTP1Q6DN14 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
MCTP1Q6DN14 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
MCTP1Q6DN14 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MCTP1Q6DN14 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC24.8■■□□□ 1.56
MCTP1Q6DN14 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
MCTP1Q6DN14 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MCTP1Q6DN14 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MCTP1Q6DN14 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MCTP1Q6DN14 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
MCTP1Q6DN14 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
MCTP1Q6DN14 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
MCTP1Q6DN14 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
MCTP1Q6DN14 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MCTP1Q6DN14 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
MCTP1Q6DN14 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MCTP1Q6DN14 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
MCTP1Q6DN14 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
MCTP1Q6DN14 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MCTP1Q6DN14 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
MCTP1Q6DN14 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MCTP1Q6DN14 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
MCTP1Q6DN14 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
MCTP1Q6DN14 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MCTP1Q6DN14 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
MCTP1Q6DN14 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MCTP1Q6DN14 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
MCTP1Q6DN14 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
MCTP1Q6DN14 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
MCTP1Q6DN14 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MCTP1Q6DN14 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MCTP1Q6DN14 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MCTP1Q6DN14 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MCTP1Q6DN14 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
MCTP1Q6DN14 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MCTP1Q6DN14 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MCTP1Q6DN14 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MCTP1Q6DN14 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MCTP1Q6DN14 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
MCTP1Q6DN14 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MCTP1Q6DN14 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
MCTP1Q6DN14 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
MCTP1Q6DN14 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
MCTP1Q6DN14 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
MCTP1Q6DN14 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
MCTP1Q6DN14 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
MCTP1Q6DN14 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MCTP1Q6DN14 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MCTP1Q6DN14 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MCTP1Q6DN14 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
MCTP1Q6DN14 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MCTP1Q6DN14 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MCTP1Q6DN14 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MCTP1Q6DN14 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MCTP1Q6DN14 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC24.77■■□□□ 1.56
MCTP1Q6DN14 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC24.77■■□□□ 1.56
MCTP1Q6DN14 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
MCTP1Q6DN14 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
MCTP1Q6DN14 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
MCTP1Q6DN14 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MCTP1Q6DN14 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MCTP1Q6DN14 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MCTP1Q6DN14 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
MCTP1Q6DN14 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MCTP1Q6DN14 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MCTP1Q6DN14 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MCTP1Q6DN14 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MCTP1Q6DN14 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MCTP1Q6DN14 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MCTP1Q6DN14 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MCTP1Q6DN14 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MCTP1Q6DN14 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MCTP1Q6DN14 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MCTP1Q6DN14 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MCTP1Q6DN14 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MCTP1Q6DN14 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MCTP1Q6DN14 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MCTP1Q6DN14 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MCTP1Q6DN14 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MCTP1Q6DN14 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MCTP1Q6DN14 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MCTP1Q6DN14 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MCTP1Q6DN14 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms