Protein–RNA interactions for Protein: Q68G74

LHX8, LIM/homeobox protein Lhx8, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX8Q68G74 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LHX8Q68G74 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LHX8Q68G74 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
LHX8Q68G74 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LHX8Q68G74 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
LHX8Q68G74 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
LHX8Q68G74 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LHX8Q68G74 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
LHX8Q68G74 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
LHX8Q68G74 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LHX8Q68G74 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LHX8Q68G74 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LHX8Q68G74 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LHX8Q68G74 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LHX8Q68G74 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LHX8Q68G74 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LHX8Q68G74 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LHX8Q68G74 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LHX8Q68G74 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LHX8Q68G74 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LHX8Q68G74 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LHX8Q68G74 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LHX8Q68G74 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LHX8Q68G74 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LHX8Q68G74 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LHX8Q68G74 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LHX8Q68G74 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LHX8Q68G74 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LHX8Q68G74 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LHX8Q68G74 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LHX8Q68G74 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LHX8Q68G74 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
LHX8Q68G74 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LHX8Q68G74 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LHX8Q68G74 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LHX8Q68G74 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
LHX8Q68G74 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LHX8Q68G74 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
LHX8Q68G74 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
LHX8Q68G74 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
LHX8Q68G74 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LHX8Q68G74 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
LHX8Q68G74 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LHX8Q68G74 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
LHX8Q68G74 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
LHX8Q68G74 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LHX8Q68G74 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LHX8Q68G74 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LHX8Q68G74 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LHX8Q68G74 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LHX8Q68G74 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LHX8Q68G74 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LHX8Q68G74 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
LHX8Q68G74 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LHX8Q68G74 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LHX8Q68G74 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LHX8Q68G74 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LHX8Q68G74 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
LHX8Q68G74 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LHX8Q68G74 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LHX8Q68G74 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
LHX8Q68G74 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LHX8Q68G74 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LHX8Q68G74 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LHX8Q68G74 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
LHX8Q68G74 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LHX8Q68G74 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LHX8Q68G74 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
LHX8Q68G74 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LHX8Q68G74 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
LHX8Q68G74 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LHX8Q68G74 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LHX8Q68G74 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LHX8Q68G74 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LHX8Q68G74 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LHX8Q68G74 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LHX8Q68G74 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
LHX8Q68G74 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LHX8Q68G74 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LHX8Q68G74 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LHX8Q68G74 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LHX8Q68G74 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LHX8Q68G74 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LHX8Q68G74 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LHX8Q68G74 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LHX8Q68G74 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LHX8Q68G74 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LHX8Q68G74 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LHX8Q68G74 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LHX8Q68G74 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LHX8Q68G74 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LHX8Q68G74 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LHX8Q68G74 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LHX8Q68G74 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LHX8Q68G74 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LHX8Q68G74 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LHX8Q68G74 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LHX8Q68G74 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LHX8Q68G74 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LHX8Q68G74 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms