Protein–RNA interactions for Protein: Q658N2

WSCD1, WSC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WSCD1Q658N2 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
WSCD1Q658N2 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
WSCD1Q658N2 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
WSCD1Q658N2 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
WSCD1Q658N2 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
WSCD1Q658N2 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
WSCD1Q658N2 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
WSCD1Q658N2 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
WSCD1Q658N2 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
WSCD1Q658N2 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
WSCD1Q658N2 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
WSCD1Q658N2 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
WSCD1Q658N2 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
WSCD1Q658N2 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
WSCD1Q658N2 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
WSCD1Q658N2 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
WSCD1Q658N2 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
WSCD1Q658N2 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
WSCD1Q658N2 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
WSCD1Q658N2 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
WSCD1Q658N2 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
WSCD1Q658N2 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
WSCD1Q658N2 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
WSCD1Q658N2 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
WSCD1Q658N2 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
WSCD1Q658N2 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
WSCD1Q658N2 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
WSCD1Q658N2 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
WSCD1Q658N2 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
WSCD1Q658N2 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
WSCD1Q658N2 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
WSCD1Q658N2 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
WSCD1Q658N2 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
WSCD1Q658N2 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
WSCD1Q658N2 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
WSCD1Q658N2 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
WSCD1Q658N2 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
WSCD1Q658N2 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
WSCD1Q658N2 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
WSCD1Q658N2 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
WSCD1Q658N2 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
WSCD1Q658N2 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
WSCD1Q658N2 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
WSCD1Q658N2 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
WSCD1Q658N2 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
WSCD1Q658N2 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
WSCD1Q658N2 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
WSCD1Q658N2 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
WSCD1Q658N2 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
WSCD1Q658N2 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
WSCD1Q658N2 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
WSCD1Q658N2 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
WSCD1Q658N2 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
WSCD1Q658N2 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
WSCD1Q658N2 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
WSCD1Q658N2 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
WSCD1Q658N2 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
WSCD1Q658N2 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
WSCD1Q658N2 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
WSCD1Q658N2 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
WSCD1Q658N2 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
WSCD1Q658N2 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
WSCD1Q658N2 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
WSCD1Q658N2 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
WSCD1Q658N2 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
WSCD1Q658N2 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
WSCD1Q658N2 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
WSCD1Q658N2 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
WSCD1Q658N2 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
WSCD1Q658N2 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
WSCD1Q658N2 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
WSCD1Q658N2 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
WSCD1Q658N2 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
WSCD1Q658N2 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
WSCD1Q658N2 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
WSCD1Q658N2 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
WSCD1Q658N2 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
WSCD1Q658N2 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
WSCD1Q658N2 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
WSCD1Q658N2 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
WSCD1Q658N2 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
WSCD1Q658N2 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
WSCD1Q658N2 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
WSCD1Q658N2 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
WSCD1Q658N2 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
WSCD1Q658N2 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
WSCD1Q658N2 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
WSCD1Q658N2 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
WSCD1Q658N2 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
WSCD1Q658N2 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
WSCD1Q658N2 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
WSCD1Q658N2 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
WSCD1Q658N2 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
WSCD1Q658N2 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
WSCD1Q658N2 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
WSCD1Q658N2 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
WSCD1Q658N2 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
WSCD1Q658N2 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
WSCD1Q658N2 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
WSCD1Q658N2 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms