Protein–RNA interactions for Protein: Q60I27

ALS2CL, ALS2 C-terminal-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALS2CLQ60I27 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ALS2CLQ60I27 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ALS2CLQ60I27 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ALS2CLQ60I27 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ALS2CLQ60I27 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ALS2CLQ60I27 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ALS2CLQ60I27 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ALS2CLQ60I27 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ALS2CLQ60I27 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ALS2CLQ60I27 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ALS2CLQ60I27 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ALS2CLQ60I27 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ALS2CLQ60I27 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ALS2CLQ60I27 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ALS2CLQ60I27 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ALS2CLQ60I27 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ALS2CLQ60I27 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ALS2CLQ60I27 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ALS2CLQ60I27 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ALS2CLQ60I27 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ALS2CLQ60I27 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ALS2CLQ60I27 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ALS2CLQ60I27 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ALS2CLQ60I27 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ALS2CLQ60I27 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ALS2CLQ60I27 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ALS2CLQ60I27 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ALS2CLQ60I27 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ALS2CLQ60I27 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ALS2CLQ60I27 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ALS2CLQ60I27 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ALS2CLQ60I27 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ALS2CLQ60I27 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ALS2CLQ60I27 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ALS2CLQ60I27 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ALS2CLQ60I27 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ALS2CLQ60I27 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ALS2CLQ60I27 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ALS2CLQ60I27 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ALS2CLQ60I27 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ALS2CLQ60I27 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ALS2CLQ60I27 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ALS2CLQ60I27 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ALS2CLQ60I27 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ALS2CLQ60I27 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ALS2CLQ60I27 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ALS2CLQ60I27 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ALS2CLQ60I27 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ALS2CLQ60I27 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ALS2CLQ60I27 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ALS2CLQ60I27 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ALS2CLQ60I27 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ALS2CLQ60I27 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ALS2CLQ60I27 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ALS2CLQ60I27 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ALS2CLQ60I27 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ALS2CLQ60I27 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ALS2CLQ60I27 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ALS2CLQ60I27 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ALS2CLQ60I27 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
ALS2CLQ60I27 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ALS2CLQ60I27 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ALS2CLQ60I27 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ALS2CLQ60I27 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
ALS2CLQ60I27 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
ALS2CLQ60I27 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ALS2CLQ60I27 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ALS2CLQ60I27 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ALS2CLQ60I27 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ALS2CLQ60I27 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ALS2CLQ60I27 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
ALS2CLQ60I27 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ALS2CLQ60I27 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ALS2CLQ60I27 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ALS2CLQ60I27 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ALS2CLQ60I27 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ALS2CLQ60I27 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ALS2CLQ60I27 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ALS2CLQ60I27 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ALS2CLQ60I27 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ALS2CLQ60I27 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ALS2CLQ60I27 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ALS2CLQ60I27 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ALS2CLQ60I27 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ALS2CLQ60I27 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ALS2CLQ60I27 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22■■□□□ 1.11
ALS2CLQ60I27 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ALS2CLQ60I27 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ALS2CLQ60I27 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ALS2CLQ60I27 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ALS2CLQ60I27 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22■■□□□ 1.11
ALS2CLQ60I27 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ALS2CLQ60I27 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22■■□□□ 1.11
ALS2CLQ60I27 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ALS2CLQ60I27 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ALS2CLQ60I27 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ALS2CLQ60I27 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ALS2CLQ60I27 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ALS2CLQ60I27 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ALS2CLQ60I27 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms