Protein–RNA interactions for Protein: Q5VXD3

SAMD13, Sterile alpha motif domain-containing protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD13Q5VXD3 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SAMD13Q5VXD3 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SAMD13Q5VXD3 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SAMD13Q5VXD3 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SAMD13Q5VXD3 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SAMD13Q5VXD3 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SAMD13Q5VXD3 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SAMD13Q5VXD3 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SAMD13Q5VXD3 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SAMD13Q5VXD3 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SAMD13Q5VXD3 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SAMD13Q5VXD3 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SAMD13Q5VXD3 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SAMD13Q5VXD3 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SAMD13Q5VXD3 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SAMD13Q5VXD3 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SAMD13Q5VXD3 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SAMD13Q5VXD3 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SAMD13Q5VXD3 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SAMD13Q5VXD3 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SAMD13Q5VXD3 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SAMD13Q5VXD3 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SAMD13Q5VXD3 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SAMD13Q5VXD3 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SAMD13Q5VXD3 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SAMD13Q5VXD3 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SAMD13Q5VXD3 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SAMD13Q5VXD3 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SAMD13Q5VXD3 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SAMD13Q5VXD3 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SAMD13Q5VXD3 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SAMD13Q5VXD3 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SAMD13Q5VXD3 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SAMD13Q5VXD3 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SAMD13Q5VXD3 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SAMD13Q5VXD3 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SAMD13Q5VXD3 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SAMD13Q5VXD3 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SAMD13Q5VXD3 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SAMD13Q5VXD3 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SAMD13Q5VXD3 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SAMD13Q5VXD3 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SAMD13Q5VXD3 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SAMD13Q5VXD3 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SAMD13Q5VXD3 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SAMD13Q5VXD3 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SAMD13Q5VXD3 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SAMD13Q5VXD3 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SAMD13Q5VXD3 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SAMD13Q5VXD3 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SAMD13Q5VXD3 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SAMD13Q5VXD3 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SAMD13Q5VXD3 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SAMD13Q5VXD3 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SAMD13Q5VXD3 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SAMD13Q5VXD3 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SAMD13Q5VXD3 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SAMD13Q5VXD3 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SAMD13Q5VXD3 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SAMD13Q5VXD3 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SAMD13Q5VXD3 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SAMD13Q5VXD3 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SAMD13Q5VXD3 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SAMD13Q5VXD3 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SAMD13Q5VXD3 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SAMD13Q5VXD3 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SAMD13Q5VXD3 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SAMD13Q5VXD3 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SAMD13Q5VXD3 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SAMD13Q5VXD3 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SAMD13Q5VXD3 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SAMD13Q5VXD3 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SAMD13Q5VXD3 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SAMD13Q5VXD3 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SAMD13Q5VXD3 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SAMD13Q5VXD3 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SAMD13Q5VXD3 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SAMD13Q5VXD3 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SAMD13Q5VXD3 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SAMD13Q5VXD3 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SAMD13Q5VXD3 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SAMD13Q5VXD3 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SAMD13Q5VXD3 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SAMD13Q5VXD3 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SAMD13Q5VXD3 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SAMD13Q5VXD3 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SAMD13Q5VXD3 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SAMD13Q5VXD3 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SAMD13Q5VXD3 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SAMD13Q5VXD3 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SAMD13Q5VXD3 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SAMD13Q5VXD3 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SAMD13Q5VXD3 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SAMD13Q5VXD3 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SAMD13Q5VXD3 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SAMD13Q5VXD3 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SAMD13Q5VXD3 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SAMD13Q5VXD3 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SAMD13Q5VXD3 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SAMD13Q5VXD3 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms