Protein–RNA interactions for Protein: Q5EBM0

CMPK2, UMP-CMP kinase 2, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 449 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMPK2Q5EBM0 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.87
CMPK2Q5EBM0 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CMPK2Q5EBM0 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CMPK2Q5EBM0 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CMPK2Q5EBM0 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CMPK2Q5EBM0 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CMPK2Q5EBM0 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CMPK2Q5EBM0 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CMPK2Q5EBM0 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CMPK2Q5EBM0 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CMPK2Q5EBM0 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CMPK2Q5EBM0 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CMPK2Q5EBM0 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CMPK2Q5EBM0 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CMPK2Q5EBM0 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CMPK2Q5EBM0 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CMPK2Q5EBM0 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CMPK2Q5EBM0 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
CMPK2Q5EBM0 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CMPK2Q5EBM0 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CMPK2Q5EBM0 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CMPK2Q5EBM0 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
CMPK2Q5EBM0 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CMPK2Q5EBM0 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CMPK2Q5EBM0 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CMPK2Q5EBM0 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CMPK2Q5EBM0 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CMPK2Q5EBM0 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CMPK2Q5EBM0 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CMPK2Q5EBM0 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CMPK2Q5EBM0 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CMPK2Q5EBM0 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CMPK2Q5EBM0 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CMPK2Q5EBM0 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CMPK2Q5EBM0 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CMPK2Q5EBM0 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CMPK2Q5EBM0 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CMPK2Q5EBM0 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CMPK2Q5EBM0 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CMPK2Q5EBM0 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CMPK2Q5EBM0 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CMPK2Q5EBM0 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CMPK2Q5EBM0 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CMPK2Q5EBM0 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CMPK2Q5EBM0 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CMPK2Q5EBM0 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CMPK2Q5EBM0 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CMPK2Q5EBM0 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CMPK2Q5EBM0 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CMPK2Q5EBM0 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CMPK2Q5EBM0 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
CMPK2Q5EBM0 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CMPK2Q5EBM0 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CMPK2Q5EBM0 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CMPK2Q5EBM0 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CMPK2Q5EBM0 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
CMPK2Q5EBM0 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CMPK2Q5EBM0 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
CMPK2Q5EBM0 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CMPK2Q5EBM0 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CMPK2Q5EBM0 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CMPK2Q5EBM0 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CMPK2Q5EBM0 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CMPK2Q5EBM0 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CMPK2Q5EBM0 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CMPK2Q5EBM0 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CMPK2Q5EBM0 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CMPK2Q5EBM0 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CMPK2Q5EBM0 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
CMPK2Q5EBM0 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
CMPK2Q5EBM0 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
CMPK2Q5EBM0 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CMPK2Q5EBM0 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CMPK2Q5EBM0 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CMPK2Q5EBM0 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
CMPK2Q5EBM0 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CMPK2Q5EBM0 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CMPK2Q5EBM0 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CMPK2Q5EBM0 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CMPK2Q5EBM0 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CMPK2Q5EBM0 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CMPK2Q5EBM0 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CMPK2Q5EBM0 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CMPK2Q5EBM0 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CMPK2Q5EBM0 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CMPK2Q5EBM0 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CMPK2Q5EBM0 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CMPK2Q5EBM0 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CMPK2Q5EBM0 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CMPK2Q5EBM0 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CMPK2Q5EBM0 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CMPK2Q5EBM0 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CMPK2Q5EBM0 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CMPK2Q5EBM0 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CMPK2Q5EBM0 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CMPK2Q5EBM0 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CMPK2Q5EBM0 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CMPK2Q5EBM0 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CMPK2Q5EBM0 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CMPK2Q5EBM0 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms