Protein–RNA interactions for Protein: Q502W7

CCDC38, Coiled-coil domain-containing protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC38Q502W7 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC38Q502W7 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC38Q502W7 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC38Q502W7 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC38Q502W7 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC38Q502W7 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC38Q502W7 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC38Q502W7 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC38Q502W7 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC38Q502W7 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC38Q502W7 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC38Q502W7 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC38Q502W7 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC38Q502W7 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC38Q502W7 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC38Q502W7 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC38Q502W7 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC38Q502W7 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC38Q502W7 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC38Q502W7 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC38Q502W7 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC38Q502W7 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC38Q502W7 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC38Q502W7 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC38Q502W7 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC38Q502W7 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC38Q502W7 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC38Q502W7 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC38Q502W7 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC38Q502W7 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC38Q502W7 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC38Q502W7 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC38Q502W7 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC38Q502W7 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC38Q502W7 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC38Q502W7 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC38Q502W7 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC38Q502W7 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC38Q502W7 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC38Q502W7 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC38Q502W7 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC38Q502W7 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC38Q502W7 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC38Q502W7 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC38Q502W7 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC38Q502W7 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC38Q502W7 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC38Q502W7 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC38Q502W7 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC38Q502W7 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC38Q502W7 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC38Q502W7 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC38Q502W7 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC38Q502W7 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC38Q502W7 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC38Q502W7 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC38Q502W7 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC38Q502W7 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC38Q502W7 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC38Q502W7 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC38Q502W7 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC38Q502W7 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC38Q502W7 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC38Q502W7 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC38Q502W7 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC38Q502W7 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC38Q502W7 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC38Q502W7 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC38Q502W7 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC38Q502W7 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC38Q502W7 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC38Q502W7 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC38Q502W7 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC38Q502W7 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC38Q502W7 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC38Q502W7 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC38Q502W7 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC38Q502W7 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC38Q502W7 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC38Q502W7 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC38Q502W7 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC38Q502W7 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC38Q502W7 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC38Q502W7 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC38Q502W7 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC38Q502W7 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC38Q502W7 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC38Q502W7 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC38Q502W7 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC38Q502W7 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC38Q502W7 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC38Q502W7 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC38Q502W7 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC38Q502W7 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC38Q502W7 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC38Q502W7 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC38Q502W7 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC38Q502W7 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC38Q502W7 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC38Q502W7 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms