Protein–RNA interactions for Protein: Q4VNC1

ATP13A4, Probable cation-transporting ATPase 13A4, humanhuman

Predictions only

Length 1,196 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP13A4Q4VNC1 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATP13A4Q4VNC1 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATP13A4Q4VNC1 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATP13A4Q4VNC1 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATP13A4Q4VNC1 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
ATP13A4Q4VNC1 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATP13A4Q4VNC1 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATP13A4Q4VNC1 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATP13A4Q4VNC1 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATP13A4Q4VNC1 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATP13A4Q4VNC1 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATP13A4Q4VNC1 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATP13A4Q4VNC1 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATP13A4Q4VNC1 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATP13A4Q4VNC1 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
ATP13A4Q4VNC1 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATP13A4Q4VNC1 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATP13A4Q4VNC1 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATP13A4Q4VNC1 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATP13A4Q4VNC1 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATP13A4Q4VNC1 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATP13A4Q4VNC1 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATP13A4Q4VNC1 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATP13A4Q4VNC1 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
ATP13A4Q4VNC1 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATP13A4Q4VNC1 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATP13A4Q4VNC1 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATP13A4Q4VNC1 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATP13A4Q4VNC1 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATP13A4Q4VNC1 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATP13A4Q4VNC1 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATP13A4Q4VNC1 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATP13A4Q4VNC1 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATP13A4Q4VNC1 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATP13A4Q4VNC1 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATP13A4Q4VNC1 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATP13A4Q4VNC1 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATP13A4Q4VNC1 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATP13A4Q4VNC1 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATP13A4Q4VNC1 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATP13A4Q4VNC1 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATP13A4Q4VNC1 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATP13A4Q4VNC1 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
ATP13A4Q4VNC1 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATP13A4Q4VNC1 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATP13A4Q4VNC1 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATP13A4Q4VNC1 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATP13A4Q4VNC1 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATP13A4Q4VNC1 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATP13A4Q4VNC1 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATP13A4Q4VNC1 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
ATP13A4Q4VNC1 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATP13A4Q4VNC1 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATP13A4Q4VNC1 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATP13A4Q4VNC1 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATP13A4Q4VNC1 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATP13A4Q4VNC1 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATP13A4Q4VNC1 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATP13A4Q4VNC1 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
ATP13A4Q4VNC1 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
ATP13A4Q4VNC1 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATP13A4Q4VNC1 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATP13A4Q4VNC1 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATP13A4Q4VNC1 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATP13A4Q4VNC1 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATP13A4Q4VNC1 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATP13A4Q4VNC1 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATP13A4Q4VNC1 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATP13A4Q4VNC1 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATP13A4Q4VNC1 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATP13A4Q4VNC1 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATP13A4Q4VNC1 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATP13A4Q4VNC1 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATP13A4Q4VNC1 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATP13A4Q4VNC1 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATP13A4Q4VNC1 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATP13A4Q4VNC1 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATP13A4Q4VNC1 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATP13A4Q4VNC1 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATP13A4Q4VNC1 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATP13A4Q4VNC1 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATP13A4Q4VNC1 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATP13A4Q4VNC1 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATP13A4Q4VNC1 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATP13A4Q4VNC1 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATP13A4Q4VNC1 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ATP13A4Q4VNC1 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ATP13A4Q4VNC1 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ATP13A4Q4VNC1 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ATP13A4Q4VNC1 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ATP13A4Q4VNC1 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ATP13A4Q4VNC1 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
ATP13A4Q4VNC1 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ATP13A4Q4VNC1 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ATP13A4Q4VNC1 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ATP13A4Q4VNC1 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ATP13A4Q4VNC1 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ATP13A4Q4VNC1 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ATP13A4Q4VNC1 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ATP13A4Q4VNC1 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms