Protein–RNA interactions for Protein: Q49AH0

CDNF, Cerebral dopamine neurotrophic factor, humanhuman

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDNFQ49AH0 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDNFQ49AH0 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDNFQ49AH0 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDNFQ49AH0 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDNFQ49AH0 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDNFQ49AH0 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDNFQ49AH0 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDNFQ49AH0 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDNFQ49AH0 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CDNFQ49AH0 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDNFQ49AH0 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDNFQ49AH0 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDNFQ49AH0 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CDNFQ49AH0 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDNFQ49AH0 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CDNFQ49AH0 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDNFQ49AH0 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDNFQ49AH0 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDNFQ49AH0 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDNFQ49AH0 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDNFQ49AH0 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDNFQ49AH0 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDNFQ49AH0 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDNFQ49AH0 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDNFQ49AH0 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDNFQ49AH0 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDNFQ49AH0 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDNFQ49AH0 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDNFQ49AH0 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDNFQ49AH0 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDNFQ49AH0 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDNFQ49AH0 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDNFQ49AH0 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDNFQ49AH0 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDNFQ49AH0 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDNFQ49AH0 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDNFQ49AH0 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDNFQ49AH0 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDNFQ49AH0 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDNFQ49AH0 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDNFQ49AH0 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDNFQ49AH0 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDNFQ49AH0 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDNFQ49AH0 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDNFQ49AH0 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDNFQ49AH0 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDNFQ49AH0 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDNFQ49AH0 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDNFQ49AH0 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDNFQ49AH0 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDNFQ49AH0 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDNFQ49AH0 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDNFQ49AH0 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDNFQ49AH0 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDNFQ49AH0 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDNFQ49AH0 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDNFQ49AH0 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDNFQ49AH0 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDNFQ49AH0 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDNFQ49AH0 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDNFQ49AH0 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDNFQ49AH0 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDNFQ49AH0 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CDNFQ49AH0 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDNFQ49AH0 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDNFQ49AH0 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDNFQ49AH0 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDNFQ49AH0 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDNFQ49AH0 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDNFQ49AH0 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDNFQ49AH0 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CDNFQ49AH0 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CDNFQ49AH0 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CDNFQ49AH0 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CDNFQ49AH0 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CDNFQ49AH0 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CDNFQ49AH0 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CDNFQ49AH0 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CDNFQ49AH0 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CDNFQ49AH0 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CDNFQ49AH0 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CDNFQ49AH0 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CDNFQ49AH0 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CDNFQ49AH0 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CDNFQ49AH0 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CDNFQ49AH0 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CDNFQ49AH0 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CDNFQ49AH0 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CDNFQ49AH0 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CDNFQ49AH0 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CDNFQ49AH0 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDNFQ49AH0 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDNFQ49AH0 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDNFQ49AH0 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDNFQ49AH0 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDNFQ49AH0 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDNFQ49AH0 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDNFQ49AH0 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDNFQ49AH0 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDNFQ49AH0 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms