Protein–RNA interactions for Protein: Q495C1

RNF212, Probable E3 SUMO-protein ligase RNF212, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF212Q495C1 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RNF212Q495C1 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RNF212Q495C1 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
RNF212Q495C1 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RNF212Q495C1 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RNF212Q495C1 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RNF212Q495C1 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RNF212Q495C1 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RNF212Q495C1 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RNF212Q495C1 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RNF212Q495C1 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RNF212Q495C1 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RNF212Q495C1 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RNF212Q495C1 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RNF212Q495C1 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RNF212Q495C1 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RNF212Q495C1 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RNF212Q495C1 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RNF212Q495C1 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RNF212Q495C1 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RNF212Q495C1 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
RNF212Q495C1 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
RNF212Q495C1 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RNF212Q495C1 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RNF212Q495C1 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RNF212Q495C1 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RNF212Q495C1 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RNF212Q495C1 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RNF212Q495C1 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RNF212Q495C1 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RNF212Q495C1 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RNF212Q495C1 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RNF212Q495C1 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RNF212Q495C1 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RNF212Q495C1 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RNF212Q495C1 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RNF212Q495C1 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RNF212Q495C1 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RNF212Q495C1 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RNF212Q495C1 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RNF212Q495C1 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RNF212Q495C1 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RNF212Q495C1 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RNF212Q495C1 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
RNF212Q495C1 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RNF212Q495C1 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RNF212Q495C1 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RNF212Q495C1 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RNF212Q495C1 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
RNF212Q495C1 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RNF212Q495C1 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RNF212Q495C1 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RNF212Q495C1 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RNF212Q495C1 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RNF212Q495C1 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RNF212Q495C1 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RNF212Q495C1 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RNF212Q495C1 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RNF212Q495C1 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RNF212Q495C1 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RNF212Q495C1 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RNF212Q495C1 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RNF212Q495C1 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RNF212Q495C1 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RNF212Q495C1 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RNF212Q495C1 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RNF212Q495C1 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RNF212Q495C1 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RNF212Q495C1 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RNF212Q495C1 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RNF212Q495C1 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RNF212Q495C1 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RNF212Q495C1 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RNF212Q495C1 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RNF212Q495C1 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RNF212Q495C1 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RNF212Q495C1 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RNF212Q495C1 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RNF212Q495C1 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RNF212Q495C1 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
RNF212Q495C1 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
RNF212Q495C1 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RNF212Q495C1 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RNF212Q495C1 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RNF212Q495C1 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RNF212Q495C1 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RNF212Q495C1 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RNF212Q495C1 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RNF212Q495C1 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RNF212Q495C1 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RNF212Q495C1 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RNF212Q495C1 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RNF212Q495C1 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RNF212Q495C1 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RNF212Q495C1 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RNF212Q495C1 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RNF212Q495C1 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RNF212Q495C1 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RNF212Q495C1 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RNF212Q495C1 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms