Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI58

KRTAP21-1, Keratin-associated protein 21-1, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP21-1Q3LI58 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
KRTAP21-1Q3LI58 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
KRTAP21-1Q3LI58 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
KRTAP21-1Q3LI58 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
KRTAP21-1Q3LI58 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
KRTAP21-1Q3LI58 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
KRTAP21-1Q3LI58 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
KRTAP21-1Q3LI58 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
KRTAP21-1Q3LI58 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
KRTAP21-1Q3LI58 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
KRTAP21-1Q3LI58 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
KRTAP21-1Q3LI58 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
KRTAP21-1Q3LI58 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
KRTAP21-1Q3LI58 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
KRTAP21-1Q3LI58 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
KRTAP21-1Q3LI58 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
KRTAP21-1Q3LI58 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
KRTAP21-1Q3LI58 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
KRTAP21-1Q3LI58 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.24□□□□□ -1.89
KRTAP21-1Q3LI58 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
KRTAP21-1Q3LI58 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
KRTAP21-1Q3LI58 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
KRTAP21-1Q3LI58 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
KRTAP21-1Q3LI58 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
KRTAP21-1Q3LI58 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
KRTAP21-1Q3LI58 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
KRTAP21-1Q3LI58 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
KRTAP21-1Q3LI58 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
KRTAP21-1Q3LI58 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
KRTAP21-1Q3LI58 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
KRTAP21-1Q3LI58 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
KRTAP21-1Q3LI58 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
KRTAP21-1Q3LI58 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
KRTAP21-1Q3LI58 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
KRTAP21-1Q3LI58 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
KRTAP21-1Q3LI58 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
KRTAP21-1Q3LI58 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC3.23□□□□□ -1.89
KRTAP21-1Q3LI58 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC3.23□□□□□ -1.89
KRTAP21-1Q3LI58 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.23□□□□□ -1.89
KRTAP21-1Q3LI58 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
KRTAP21-1Q3LI58 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
KRTAP21-1Q3LI58 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
KRTAP21-1Q3LI58 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
KRTAP21-1Q3LI58 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
KRTAP21-1Q3LI58 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
KRTAP21-1Q3LI58 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
KRTAP21-1Q3LI58 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
KRTAP21-1Q3LI58 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
KRTAP21-1Q3LI58 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
KRTAP21-1Q3LI58 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
KRTAP21-1Q3LI58 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
KRTAP21-1Q3LI58 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
KRTAP21-1Q3LI58 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
KRTAP21-1Q3LI58 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
KRTAP21-1Q3LI58 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
KRTAP21-1Q3LI58 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
KRTAP21-1Q3LI58 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC3.23□□□□□ -1.89
KRTAP21-1Q3LI58 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
KRTAP21-1Q3LI58 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
KRTAP21-1Q3LI58 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
KRTAP21-1Q3LI58 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
KRTAP21-1Q3LI58 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
KRTAP21-1Q3LI58 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
KRTAP21-1Q3LI58 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
KRTAP21-1Q3LI58 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
KRTAP21-1Q3LI58 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
KRTAP21-1Q3LI58 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC3.23□□□□□ -1.89
KRTAP21-1Q3LI58 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC3.23□□□□□ -1.89
KRTAP21-1Q3LI58 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
KRTAP21-1Q3LI58 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC3.23□□□□□ -1.89
KRTAP21-1Q3LI58 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC3.23□□□□□ -1.89
KRTAP21-1Q3LI58 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
KRTAP21-1Q3LI58 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.23□□□□□ -1.89
KRTAP21-1Q3LI58 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
KRTAP21-1Q3LI58 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.23□□□□□ -1.89
KRTAP21-1Q3LI58 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
KRTAP21-1Q3LI58 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
KRTAP21-1Q3LI58 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
KRTAP21-1Q3LI58 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
KRTAP21-1Q3LI58 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC3.23□□□□□ -1.89
KRTAP21-1Q3LI58 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
KRTAP21-1Q3LI58 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
KRTAP21-1Q3LI58 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
KRTAP21-1Q3LI58 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
KRTAP21-1Q3LI58 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC3.23□□□□□ -1.89
KRTAP21-1Q3LI58 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC3.23□□□□□ -1.89
KRTAP21-1Q3LI58 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
KRTAP21-1Q3LI58 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
KRTAP21-1Q3LI58 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
KRTAP21-1Q3LI58 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC3.23□□□□□ -1.89
KRTAP21-1Q3LI58 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
KRTAP21-1Q3LI58 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC3.23□□□□□ -1.89
KRTAP21-1Q3LI58 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC3.23□□□□□ -1.89
KRTAP21-1Q3LI58 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
KRTAP21-1Q3LI58 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
KRTAP21-1Q3LI58 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
KRTAP21-1Q3LI58 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.23□□□□□ -1.89
KRTAP21-1Q3LI58 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC3.23□□□□□ -1.89
KRTAP21-1Q3LI58 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
KRTAP21-1Q3LI58 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms