Protein–RNA interactions for Protein: Q2TAL6

VWC2, Brorin, humanhuman

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWC2Q2TAL6 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
VWC2Q2TAL6 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
VWC2Q2TAL6 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
VWC2Q2TAL6 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
VWC2Q2TAL6 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
VWC2Q2TAL6 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
VWC2Q2TAL6 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
VWC2Q2TAL6 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
VWC2Q2TAL6 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
VWC2Q2TAL6 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
VWC2Q2TAL6 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
VWC2Q2TAL6 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
VWC2Q2TAL6 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
VWC2Q2TAL6 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
VWC2Q2TAL6 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
VWC2Q2TAL6 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
VWC2Q2TAL6 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
VWC2Q2TAL6 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
VWC2Q2TAL6 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
VWC2Q2TAL6 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
VWC2Q2TAL6 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
VWC2Q2TAL6 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
VWC2Q2TAL6 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
VWC2Q2TAL6 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
VWC2Q2TAL6 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
VWC2Q2TAL6 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
VWC2Q2TAL6 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
VWC2Q2TAL6 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
VWC2Q2TAL6 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
VWC2Q2TAL6 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
VWC2Q2TAL6 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
VWC2Q2TAL6 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
VWC2Q2TAL6 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
VWC2Q2TAL6 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
VWC2Q2TAL6 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
VWC2Q2TAL6 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
VWC2Q2TAL6 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
VWC2Q2TAL6 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
VWC2Q2TAL6 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
VWC2Q2TAL6 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
VWC2Q2TAL6 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
VWC2Q2TAL6 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
VWC2Q2TAL6 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
VWC2Q2TAL6 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
VWC2Q2TAL6 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
VWC2Q2TAL6 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
VWC2Q2TAL6 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
VWC2Q2TAL6 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
VWC2Q2TAL6 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
VWC2Q2TAL6 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
VWC2Q2TAL6 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
VWC2Q2TAL6 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
VWC2Q2TAL6 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
VWC2Q2TAL6 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
VWC2Q2TAL6 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
VWC2Q2TAL6 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
VWC2Q2TAL6 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
VWC2Q2TAL6 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
VWC2Q2TAL6 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
VWC2Q2TAL6 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
VWC2Q2TAL6 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
VWC2Q2TAL6 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
VWC2Q2TAL6 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
VWC2Q2TAL6 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
VWC2Q2TAL6 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
VWC2Q2TAL6 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
VWC2Q2TAL6 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
VWC2Q2TAL6 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
VWC2Q2TAL6 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
VWC2Q2TAL6 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
VWC2Q2TAL6 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
VWC2Q2TAL6 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
VWC2Q2TAL6 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
VWC2Q2TAL6 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
VWC2Q2TAL6 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
VWC2Q2TAL6 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
VWC2Q2TAL6 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
VWC2Q2TAL6 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
VWC2Q2TAL6 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
VWC2Q2TAL6 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
VWC2Q2TAL6 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
VWC2Q2TAL6 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
VWC2Q2TAL6 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
VWC2Q2TAL6 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
VWC2Q2TAL6 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
VWC2Q2TAL6 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
VWC2Q2TAL6 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
VWC2Q2TAL6 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
VWC2Q2TAL6 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
VWC2Q2TAL6 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
VWC2Q2TAL6 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
VWC2Q2TAL6 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
VWC2Q2TAL6 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
VWC2Q2TAL6 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
VWC2Q2TAL6 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
VWC2Q2TAL6 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
VWC2Q2TAL6 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
VWC2Q2TAL6 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
VWC2Q2TAL6 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
VWC2Q2TAL6 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms