Protein–RNA interactions for Protein: Q2T9J0

TYSND1, Peroxisomal leader peptide-processing protease, humanhuman

Predictions only

Length 566 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TYSND1Q2T9J0 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TYSND1Q2T9J0 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TYSND1Q2T9J0 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TYSND1Q2T9J0 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TYSND1Q2T9J0 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TYSND1Q2T9J0 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TYSND1Q2T9J0 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TYSND1Q2T9J0 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TYSND1Q2T9J0 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TYSND1Q2T9J0 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TYSND1Q2T9J0 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TYSND1Q2T9J0 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TYSND1Q2T9J0 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TYSND1Q2T9J0 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
TYSND1Q2T9J0 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TYSND1Q2T9J0 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TYSND1Q2T9J0 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TYSND1Q2T9J0 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TYSND1Q2T9J0 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TYSND1Q2T9J0 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TYSND1Q2T9J0 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TYSND1Q2T9J0 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TYSND1Q2T9J0 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TYSND1Q2T9J0 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TYSND1Q2T9J0 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TYSND1Q2T9J0 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TYSND1Q2T9J0 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TYSND1Q2T9J0 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TYSND1Q2T9J0 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TYSND1Q2T9J0 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TYSND1Q2T9J0 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TYSND1Q2T9J0 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TYSND1Q2T9J0 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TYSND1Q2T9J0 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TYSND1Q2T9J0 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TYSND1Q2T9J0 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TYSND1Q2T9J0 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TYSND1Q2T9J0 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TYSND1Q2T9J0 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TYSND1Q2T9J0 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TYSND1Q2T9J0 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TYSND1Q2T9J0 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TYSND1Q2T9J0 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TYSND1Q2T9J0 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TYSND1Q2T9J0 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TYSND1Q2T9J0 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TYSND1Q2T9J0 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TYSND1Q2T9J0 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
TYSND1Q2T9J0 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TYSND1Q2T9J0 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TYSND1Q2T9J0 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TYSND1Q2T9J0 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TYSND1Q2T9J0 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TYSND1Q2T9J0 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TYSND1Q2T9J0 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TYSND1Q2T9J0 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TYSND1Q2T9J0 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TYSND1Q2T9J0 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TYSND1Q2T9J0 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TYSND1Q2T9J0 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TYSND1Q2T9J0 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TYSND1Q2T9J0 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TYSND1Q2T9J0 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TYSND1Q2T9J0 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
TYSND1Q2T9J0 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
TYSND1Q2T9J0 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TYSND1Q2T9J0 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TYSND1Q2T9J0 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TYSND1Q2T9J0 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TYSND1Q2T9J0 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TYSND1Q2T9J0 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TYSND1Q2T9J0 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TYSND1Q2T9J0 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
TYSND1Q2T9J0 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
TYSND1Q2T9J0 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TYSND1Q2T9J0 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
TYSND1Q2T9J0 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TYSND1Q2T9J0 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TYSND1Q2T9J0 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TYSND1Q2T9J0 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
TYSND1Q2T9J0 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TYSND1Q2T9J0 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
TYSND1Q2T9J0 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
TYSND1Q2T9J0 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TYSND1Q2T9J0 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TYSND1Q2T9J0 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
TYSND1Q2T9J0 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TYSND1Q2T9J0 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TYSND1Q2T9J0 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TYSND1Q2T9J0 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TYSND1Q2T9J0 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TYSND1Q2T9J0 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TYSND1Q2T9J0 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TYSND1Q2T9J0 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TYSND1Q2T9J0 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TYSND1Q2T9J0 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TYSND1Q2T9J0 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TYSND1Q2T9J0 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
TYSND1Q2T9J0 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TYSND1Q2T9J0 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms