Protein–RNA interactions for Protein: Q1XH10

SKIDA1, SKI/DACH domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 827 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIDA1Q1XH10 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SKIDA1Q1XH10 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SKIDA1Q1XH10 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SKIDA1Q1XH10 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SKIDA1Q1XH10 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SKIDA1Q1XH10 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SKIDA1Q1XH10 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SKIDA1Q1XH10 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SKIDA1Q1XH10 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SKIDA1Q1XH10 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SKIDA1Q1XH10 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SKIDA1Q1XH10 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SKIDA1Q1XH10 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SKIDA1Q1XH10 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SKIDA1Q1XH10 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SKIDA1Q1XH10 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SKIDA1Q1XH10 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SKIDA1Q1XH10 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SKIDA1Q1XH10 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SKIDA1Q1XH10 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SKIDA1Q1XH10 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SKIDA1Q1XH10 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SKIDA1Q1XH10 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SKIDA1Q1XH10 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SKIDA1Q1XH10 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SKIDA1Q1XH10 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SKIDA1Q1XH10 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SKIDA1Q1XH10 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SKIDA1Q1XH10 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SKIDA1Q1XH10 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SKIDA1Q1XH10 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SKIDA1Q1XH10 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SKIDA1Q1XH10 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SKIDA1Q1XH10 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SKIDA1Q1XH10 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SKIDA1Q1XH10 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SKIDA1Q1XH10 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SKIDA1Q1XH10 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SKIDA1Q1XH10 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SKIDA1Q1XH10 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SKIDA1Q1XH10 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SKIDA1Q1XH10 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SKIDA1Q1XH10 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SKIDA1Q1XH10 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SKIDA1Q1XH10 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SKIDA1Q1XH10 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SKIDA1Q1XH10 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SKIDA1Q1XH10 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SKIDA1Q1XH10 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SKIDA1Q1XH10 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SKIDA1Q1XH10 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SKIDA1Q1XH10 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SKIDA1Q1XH10 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SKIDA1Q1XH10 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SKIDA1Q1XH10 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SKIDA1Q1XH10 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SKIDA1Q1XH10 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SKIDA1Q1XH10 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SKIDA1Q1XH10 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SKIDA1Q1XH10 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SKIDA1Q1XH10 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SKIDA1Q1XH10 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SKIDA1Q1XH10 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SKIDA1Q1XH10 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SKIDA1Q1XH10 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SKIDA1Q1XH10 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SKIDA1Q1XH10 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SKIDA1Q1XH10 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SKIDA1Q1XH10 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SKIDA1Q1XH10 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SKIDA1Q1XH10 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SKIDA1Q1XH10 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SKIDA1Q1XH10 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SKIDA1Q1XH10 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SKIDA1Q1XH10 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SKIDA1Q1XH10 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SKIDA1Q1XH10 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SKIDA1Q1XH10 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SKIDA1Q1XH10 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SKIDA1Q1XH10 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SKIDA1Q1XH10 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SKIDA1Q1XH10 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SKIDA1Q1XH10 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SKIDA1Q1XH10 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SKIDA1Q1XH10 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SKIDA1Q1XH10 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SKIDA1Q1XH10 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SKIDA1Q1XH10 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SKIDA1Q1XH10 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SKIDA1Q1XH10 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SKIDA1Q1XH10 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SKIDA1Q1XH10 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SKIDA1Q1XH10 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SKIDA1Q1XH10 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SKIDA1Q1XH10 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SKIDA1Q1XH10 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SKIDA1Q1XH10 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SKIDA1Q1XH10 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SKIDA1Q1XH10 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SKIDA1Q1XH10 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
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