Protein–RNA interactions for Protein: Q16656

NRF1, Nuclear respiratory factor 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRF1Q16656 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NRF1Q16656 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NRF1Q16656 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NRF1Q16656 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NRF1Q16656 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NRF1Q16656 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NRF1Q16656 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NRF1Q16656 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NRF1Q16656 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NRF1Q16656 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NRF1Q16656 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NRF1Q16656 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NRF1Q16656 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
NRF1Q16656 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
NRF1Q16656 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NRF1Q16656 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NRF1Q16656 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
NRF1Q16656 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NRF1Q16656 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
NRF1Q16656 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NRF1Q16656 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NRF1Q16656 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NRF1Q16656 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NRF1Q16656 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NRF1Q16656 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NRF1Q16656 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NRF1Q16656 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NRF1Q16656 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NRF1Q16656 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NRF1Q16656 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
NRF1Q16656 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NRF1Q16656 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NRF1Q16656 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NRF1Q16656 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
NRF1Q16656 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NRF1Q16656 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NRF1Q16656 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NRF1Q16656 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
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NRF1Q16656 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NRF1Q16656 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
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NRF1Q16656 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
NRF1Q16656 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NRF1Q16656 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
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NRF1Q16656 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NRF1Q16656 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NRF1Q16656 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
NRF1Q16656 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NRF1Q16656 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
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NRF1Q16656 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
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NRF1Q16656 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
NRF1Q16656 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC20.02■□□□□ 0.79
NRF1Q16656 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NRF1Q16656 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NRF1Q16656 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
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NRF1Q16656 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NRF1Q16656 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NRF1Q16656 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NRF1Q16656 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
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NRF1Q16656 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
NRF1Q16656 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
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NRF1Q16656 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC20■□□□□ 0.79
NRF1Q16656 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
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NRF1Q16656 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NRF1Q16656 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NRF1Q16656 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
NRF1Q16656 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
NRF1Q16656 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NRF1Q16656 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
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