Protein–RNA interactions for Protein: Q16512

PKN1, Serine/threonine-protein kinase N1, humanhuman

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Length 942 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKN1Q16512 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PKN1Q16512 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PKN1Q16512 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PKN1Q16512 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PKN1Q16512 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PKN1Q16512 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PKN1Q16512 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PKN1Q16512 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PKN1Q16512 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PKN1Q16512 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PKN1Q16512 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PKN1Q16512 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PKN1Q16512 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PKN1Q16512 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PKN1Q16512 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PKN1Q16512 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
PKN1Q16512 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PKN1Q16512 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PKN1Q16512 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PKN1Q16512 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PKN1Q16512 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PKN1Q16512 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PKN1Q16512 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PKN1Q16512 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PKN1Q16512 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PKN1Q16512 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PKN1Q16512 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PKN1Q16512 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
PKN1Q16512 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PKN1Q16512 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PKN1Q16512 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PKN1Q16512 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PKN1Q16512 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
PKN1Q16512 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
PKN1Q16512 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
PKN1Q16512 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PKN1Q16512 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PKN1Q16512 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PKN1Q16512 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PKN1Q16512 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PKN1Q16512 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PKN1Q16512 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PKN1Q16512 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PKN1Q16512 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PKN1Q16512 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PKN1Q16512 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PKN1Q16512 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
PKN1Q16512 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PKN1Q16512 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PKN1Q16512 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PKN1Q16512 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PKN1Q16512 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PKN1Q16512 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PKN1Q16512 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PKN1Q16512 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PKN1Q16512 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PKN1Q16512 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
PKN1Q16512 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PKN1Q16512 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PKN1Q16512 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PKN1Q16512 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PKN1Q16512 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PKN1Q16512 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PKN1Q16512 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PKN1Q16512 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PKN1Q16512 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
PKN1Q16512 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PKN1Q16512 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
PKN1Q16512 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PKN1Q16512 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PKN1Q16512 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PKN1Q16512 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PKN1Q16512 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PKN1Q16512 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PKN1Q16512 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PKN1Q16512 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
PKN1Q16512 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PKN1Q16512 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PKN1Q16512 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PKN1Q16512 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PKN1Q16512 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
PKN1Q16512 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PKN1Q16512 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PKN1Q16512 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PKN1Q16512 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PKN1Q16512 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PKN1Q16512 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PKN1Q16512 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PKN1Q16512 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PKN1Q16512 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PKN1Q16512 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PKN1Q16512 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PKN1Q16512 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PKN1Q16512 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PKN1Q16512 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PKN1Q16512 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PKN1Q16512 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PKN1Q16512 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PKN1Q16512 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PKN1Q16512 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
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