Protein–RNA interactions for Protein: Q16478

GRIK5, Glutamate receptor ionotropic, kainate 5, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK5Q16478 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GRIK5Q16478 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GRIK5Q16478 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GRIK5Q16478 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GRIK5Q16478 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GRIK5Q16478 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GRIK5Q16478 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GRIK5Q16478 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
GRIK5Q16478 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GRIK5Q16478 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GRIK5Q16478 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GRIK5Q16478 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
GRIK5Q16478 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GRIK5Q16478 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
GRIK5Q16478 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
GRIK5Q16478 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GRIK5Q16478 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
GRIK5Q16478 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GRIK5Q16478 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
GRIK5Q16478 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
GRIK5Q16478 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
GRIK5Q16478 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
GRIK5Q16478 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
GRIK5Q16478 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
GRIK5Q16478 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
GRIK5Q16478 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
GRIK5Q16478 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
GRIK5Q16478 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
GRIK5Q16478 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
GRIK5Q16478 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
GRIK5Q16478 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
GRIK5Q16478 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
GRIK5Q16478 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
GRIK5Q16478 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
GRIK5Q16478 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
GRIK5Q16478 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
GRIK5Q16478 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
GRIK5Q16478 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
GRIK5Q16478 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
GRIK5Q16478 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
GRIK5Q16478 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
GRIK5Q16478 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
GRIK5Q16478 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
GRIK5Q16478 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
GRIK5Q16478 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
GRIK5Q16478 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
GRIK5Q16478 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GRIK5Q16478 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
GRIK5Q16478 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
GRIK5Q16478 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
GRIK5Q16478 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GRIK5Q16478 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GRIK5Q16478 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
GRIK5Q16478 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
GRIK5Q16478 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GRIK5Q16478 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
GRIK5Q16478 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
GRIK5Q16478 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
GRIK5Q16478 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
GRIK5Q16478 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GRIK5Q16478 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
GRIK5Q16478 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GRIK5Q16478 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
GRIK5Q16478 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GRIK5Q16478 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
GRIK5Q16478 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
GRIK5Q16478 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
GRIK5Q16478 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GRIK5Q16478 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
GRIK5Q16478 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
GRIK5Q16478 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GRIK5Q16478 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GRIK5Q16478 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
GRIK5Q16478 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
GRIK5Q16478 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GRIK5Q16478 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GRIK5Q16478 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
GRIK5Q16478 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
GRIK5Q16478 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GRIK5Q16478 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
GRIK5Q16478 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GRIK5Q16478 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
GRIK5Q16478 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
GRIK5Q16478 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GRIK5Q16478 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
GRIK5Q16478 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
GRIK5Q16478 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GRIK5Q16478 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GRIK5Q16478 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GRIK5Q16478 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GRIK5Q16478 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GRIK5Q16478 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GRIK5Q16478 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GRIK5Q16478 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GRIK5Q16478 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GRIK5Q16478 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GRIK5Q16478 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GRIK5Q16478 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GRIK5Q16478 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GRIK5Q16478 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
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