Protein–RNA interactions for Protein: Q16204

CCDC6, Coiled-coil domain-containing protein 6, humanhuman

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Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC6Q16204 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC6Q16204 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC6Q16204 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC6Q16204 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC6Q16204 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC6Q16204 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC6Q16204 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC6Q16204 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC6Q16204 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC6Q16204 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC6Q16204 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC6Q16204 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC6Q16204 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC6Q16204 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC6Q16204 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC6Q16204 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC6Q16204 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC6Q16204 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC6Q16204 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC6Q16204 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC6Q16204 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC6Q16204 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC6Q16204 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC6Q16204 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC6Q16204 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC6Q16204 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC6Q16204 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC6Q16204 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC6Q16204 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC6Q16204 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC6Q16204 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC6Q16204 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC6Q16204 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC6Q16204 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC6Q16204 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC6Q16204 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC6Q16204 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CCDC6Q16204 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
CCDC6Q16204 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CCDC6Q16204 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CCDC6Q16204 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CCDC6Q16204 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CCDC6Q16204 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC6Q16204 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC6Q16204 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC6Q16204 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC6Q16204 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC6Q16204 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC6Q16204 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC6Q16204 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC6Q16204 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC6Q16204 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC6Q16204 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC6Q16204 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC6Q16204 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC6Q16204 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC6Q16204 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC6Q16204 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC6Q16204 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC6Q16204 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC6Q16204 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC6Q16204 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC6Q16204 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC6Q16204 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC6Q16204 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC6Q16204 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC6Q16204 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC6Q16204 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC6Q16204 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC6Q16204 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC6Q16204 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC6Q16204 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC6Q16204 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC6Q16204 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC6Q16204 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC6Q16204 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC6Q16204 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC6Q16204 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC6Q16204 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC6Q16204 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC6Q16204 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC6Q16204 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC6Q16204 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC6Q16204 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC6Q16204 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC6Q16204 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC6Q16204 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC6Q16204 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC6Q16204 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC6Q16204 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC6Q16204 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC6Q16204 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC6Q16204 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC6Q16204 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC6Q16204 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC6Q16204 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC6Q16204 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC6Q16204 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC6Q16204 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC6Q16204 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
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