Protein–RNA interactions for Protein: Q16143

SNCB, Beta-synuclein, humanhuman

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Length 134 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNCBQ16143 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SNCBQ16143 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SNCBQ16143 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SNCBQ16143 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SNCBQ16143 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SNCBQ16143 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SNCBQ16143 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SNCBQ16143 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SNCBQ16143 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SNCBQ16143 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SNCBQ16143 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SNCBQ16143 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SNCBQ16143 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SNCBQ16143 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SNCBQ16143 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SNCBQ16143 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SNCBQ16143 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SNCBQ16143 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SNCBQ16143 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SNCBQ16143 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SNCBQ16143 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SNCBQ16143 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SNCBQ16143 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SNCBQ16143 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SNCBQ16143 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SNCBQ16143 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SNCBQ16143 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
SNCBQ16143 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SNCBQ16143 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SNCBQ16143 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SNCBQ16143 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SNCBQ16143 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SNCBQ16143 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SNCBQ16143 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SNCBQ16143 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SNCBQ16143 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SNCBQ16143 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
SNCBQ16143 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SNCBQ16143 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SNCBQ16143 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SNCBQ16143 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SNCBQ16143 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SNCBQ16143 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SNCBQ16143 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SNCBQ16143 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SNCBQ16143 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SNCBQ16143 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SNCBQ16143 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SNCBQ16143 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SNCBQ16143 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SNCBQ16143 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SNCBQ16143 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SNCBQ16143 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SNCBQ16143 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SNCBQ16143 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SNCBQ16143 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SNCBQ16143 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SNCBQ16143 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SNCBQ16143 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SNCBQ16143 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SNCBQ16143 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SNCBQ16143 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SNCBQ16143 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SNCBQ16143 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
SNCBQ16143 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SNCBQ16143 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SNCBQ16143 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SNCBQ16143 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SNCBQ16143 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SNCBQ16143 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SNCBQ16143 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SNCBQ16143 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SNCBQ16143 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SNCBQ16143 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SNCBQ16143 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SNCBQ16143 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SNCBQ16143 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SNCBQ16143 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SNCBQ16143 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SNCBQ16143 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
SNCBQ16143 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SNCBQ16143 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SNCBQ16143 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SNCBQ16143 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SNCBQ16143 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SNCBQ16143 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SNCBQ16143 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SNCBQ16143 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SNCBQ16143 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SNCBQ16143 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SNCBQ16143 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SNCBQ16143 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SNCBQ16143 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SNCBQ16143 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SNCBQ16143 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SNCBQ16143 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SNCBQ16143 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SNCBQ16143 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SNCBQ16143 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SNCBQ16143 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
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